Funkční charakterizace nové varianty genu SBDS asociované se Shwachmanovým-Diamondovým syndromem

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F25%3A00143680" target="_blank" >RIV/00216224:14740/25:00143680 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://csklg.cz/" target="_blank" >https://csklg.cz/</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Funkční charakterizace nové varianty genu SBDS asociované se Shwachmanovým-Diamondovým syndromem

Popis výsledku v původním jazyce

Shwachmanův–Diamondův syndrom (SDS) je vzácné autozomálně recesivní onemocnění charakterizované především dysfunkcí kostní dřeně, exokrinní pankreatickou insuficiencí a abnormalitami skeletu. Přibližně 90 % pacientů s SDS je nositelem patogenních bialelických variant v genu SBDS, který kóduje protein podílející se na sestavování ribozomů. Patogenní varianty SBDS jsou spojeny se sníženou expresí proteinu SBDS a zvýšenou expresí nádorového supresorového proteinu p53. Zde uvádíme funkční charakterizaci dosud nepopsané varianty c.536C&gt;T; p.(Arg179Leu), která byla spolu se známou patogenní variantou c.355T&gt;C; p.(Cys119Arg) přítomna v genu SBDS (NM_016038.4) u 2 pacientů (sourozenců) s SDS. Funkční význam byl hodnocen in vitro pomocí overexprese SBDS s každou výše uvedenou variantou a SBDS divokého typu v buňkách HeLa. Životaschopnost buněk, proliferace a buněčný cyklus byly hodnoceny pomocí průtokové cytometrie, exprese proteinů SBDS a p53 byla sledována pomocí western blotu. Žádná z variant neovlivnila životaschopnost buněk, proliferaci ani buněčný cyklus ve srovnání s divokým typem SBDS. Obě varianty však vedly ke snížené expresi proteinu SBDS. Varianta c.355T&gt;C navíc překvapivě snížila expresi proteinu p53. Naše zjištění potvrzují patogenitu nové varianty c.536C&gt;T. Tato studie zavádí protokol funkčního testování použitelný pro hodnocení klinického významu dalších variant genu SBDS. Tyto poznatky přispívají k hlubšímu pochopení patogeneze SDS.

Název v anglickém jazyce

Functional characterization of a novel SBDS gene variant associated with Shwachman-Diamond syndrome

Popis výsledku anglicky

Shwachman–Diamond syndrome (SDS) is a rare autosomal recessive disorder primarily characterized by bone marrow dysfunction, exocrine pancreatic insufficiency, and skeletal abnormalities. Approximately 90% of SDS patients carry pathogenic biallelic variants in the SBDS gene, which encodes a protein involved in ribosome assembly. Pathogenic SBDS variants are associated with reduced SBDS protein expression and increased expression of the tumor suppressor protein p53. Here, we present the functional characterization of a previously undescribed variant, c.536C&gt;T (p.Arg179Leu), which was identified together with the known pathogenic variant c.355T&gt;C (p.Cys119Arg) in the SBDS gene (NM_016038.4) in two siblings with SDS. Functional impact was evaluated in vitro using overexpression of SBDS carrying each of the above variants and wild-type SBDS in cell lines. Cell viability, proliferation, and cell cycle were assessed by flow cytometry, while SBDS and p53 protein expression levels were analyzed by Western blot. Neither variant affected cell viability, proliferation, or cell cycle compared with wild-type SBDS. However, both variants led to reduced SBDS protein expression. Additionally, the c.355T&gt;C variant unexpectedly decreased p53 protein expression. Our findings confirm the pathogenicity of the novel c.536C&gt;T variant. This study introduces a functional testing protocol applicable for evaluating the clinical significance of additional SBDS variants. These findings contribute to a deeper understanding of SDS pathogenesis.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

30200 - Clinical medicine

Projekt

<a href="/cs/project/LX22NPO5102" target="_blank" >LX22NPO5102: Národní ústav pro výzkum rakoviny</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2025

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů