Problematika detekce rodu Arcobacter metodou PCR

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216275%3A25310%2F04%3A00001656" target="_blank" >RIV/00216275:25310/04:00001656 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Problematika detekce rodu Arcobacter metodou PCR

Popis výsledku v původním jazyce

Tato práce se zabývá využitím metody PCR k urychlení a zpřesnění důkazu arkobakterů izolovaných z potravin a z vody a sleduje vliv matrice vzorku. Metoda využívá dvou párů primerů, rodově specifického (Arcobacter) a druhově specifického (A. butzleri). Specifita a citlivost optimalizované metody PCR byla ověřena na sbírkových kmenech Arcobacter butzleri CCUG 30484, Arcobacter cryaerophilus CCM 3933 a Arcobacter cryaerophilus CCM 3934.Dále byla prováděna přímá analýza pomnožovacích médií s vynecháním kultivačního kroku na pevném médiu. Pro urychlení detekce arkobakterů byla testována 4 pomnožovací média. Nejlepší výsledky poskytoval F6 selektivní bujón.U uměle kontaminovaných vzorků kuřecího, vepřového a hovězího masa byl sledován vliv matrice vzorku. Zvolená kombinace pomnožovacího média a pevné půdy byla vysoce selektivní. Jednotlivé druhy masa se liší obsahem tuku, který měl vliv na detekci arkobakterů.Metodou PCR bylo vyšetřeno 69 vzorků. Arcobacter spp. byl nalezen ve 29 případech (

Název v anglickém jazyce

Detection of Arcobacter using PCR method

Popis výsledku anglicky

Method of optimized multiplex PCR was verified on reference strains Arcobacter butzleri CCUG 30484, Arcobacter cryaerophilus CCM 3933 and Arcobacter cryaerophilus CCM 3934.Direct analysis of enrichment broths takeing-off a culture step was performed. Four enrichment media were tested for the acceleration of arcobacters´ detection. F6 selective broth yielded the best results.Poultry, porcine and bovine samples were artificially contaminated and the influnce of samples´ matrix was investigated. A choice combination of an enrichment broth and a plating agar was highly selective. Sorts of meat differ in a content of fat, which had an influence on a detection of arcobacters.69 samples of food products and water were examined using multiplex PCR. Arcobacterspp. were found in 29 cases (42 %). Positive isolates were confirmed as A. butzleri (24,6 %) and A. cryaerophilus (17,4 %).

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GA203%2F02%2F0023" target="_blank" >GA203/02/0023: Vývoj nových postupů pro vysoce spolehlivou analyt. kontrolu technol.,materiálů,potravin a život. prostř. a pro lékařskou diag. s využitím moderní instrumentace</a><br>

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2004

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Monitorování cizorodých látek v životním prostředí VI

ISBN

80-7194-722-9

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

11

Strana od-do

295-306

Název nakladatele

Univerzita Pardubice

Místo vydání

Pardubice

Místo konání akce

Podivice

Datum konání akce

7. 4. 2004

Typ akce podle státní příslušnosti

CST - Celostátní akce

Kód UT WoS článku

—