Číslicové zpracování genomických signálů pro klasifikaci rostlin

Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26220%2F14%3APU108949" target="_blank" >RIV/00216305:26220/14:PU108949 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—

Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Číslicové zpracování genomických signálů pro klasifikaci rostlin
Popis výsledku v původním jazyce
Numerické reprezentace DNA sekvence prošly v posledních několika letech výrazným rozvojem. Existuje větší množství technik, které produkují signály s různými vlastnostmi. V této práci prezentujeme konstrukci dendrogramů pro tři různé signálové reprezentace a srovnání těchto dendrogramů s metodou založenou na vícenásobném znakovém zarovnání. Klasifikace signal je provedena jako shluková analýzay založená na Euklidovské metrice vzdáleností všech dvojic signal zarovnaných pomocí dynamického borcení časové osy.
Název v anglickém jazyce
Digital Signal Processing for Genome Classification of Plants
Popis výsledku anglicky
Numerical representations of DNA sequence underwent a significant development during last few years. Nevertheless, there are several techniques producing signals with various features. In this work, we present dendrogram construction for three different signal representations and its comparison with standard method based on multiple alignment of character sequences. Signal classification is performed as a cluster analysis using Euclidian metrics measuring pairwise distance between all pairs of signals aligned using dynamic time warping.

Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Podobné výsledky(10)