Optofluidní mikročip s teplotním gradientem pro určování teplotní stability biomolekul v segmentovaném toku

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26220%2F19%3APR32589" target="_blank" >RIV/00216305:26220/19:PR32589 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Optofluidní mikročip s teplotním gradientem pro určování teplotní stability biomolekul v segmentovaném toku

Popis výsledku v původním jazyce

Byl vyroben křemíkový čip s trubkovitými mikrokanály utopenými uvnitř substrátu s teplotním gradientem (∇T) podél mikrokanálu. Sestavili jsme optický fluorescenční systém skládající se z modulovaného laserového světelného zdroje 470 nm připojeného optickými vlákny k mikrokanálu, který sloužil jako světlovod. Fluorescence byla detekována na druhé straně mikrokanálu pomocí fotonásobiče připojeného k optickému vláknu přes fluorescein isothiokyanátový filtr. Výstup z PMT byl napojen na lock-in zesilovač. Provedli jsme analýzu křivky tání krátké sekvence dsDNA - SYBR Green I o známé teplotě tání v průtokové konfiguraci bez gradientu, abychom ověřili funkčnost navrhovaného detekčního systému. Potom jsme použili konfiguraci segmentovaného toku a změřili amplitudu fluorescence kapičky vystavené ∇T of 2,31 ° C mm-1. Navrhovaná platforma může být použita jako rychlý a nákladově efektivní systém pro provádění buď MCA dsDNA nebo pro měření rozložení proteinu pro aplikace screeningu léků.

Název v anglickém jazyce

Characterization of Biomolecules’ Thermal Stability in Segmented Flow-Through Optofluidic Microsystem

Popis výsledku anglicky

We developed a silicon chip with tubular microchannels buried inside the substrate featuring temperature gradient (∇T) along the microchannel. We set up an optical fluorescence system consisting of a power-modulated laser light source of 470 nm coupled to the microchannel serving as a light guidevia optical fiber. Fluorescence was detected on the other side of the microchannel using a photomultiplier tube connected to an optical fiber via a fluorescein isothiocyanate filter. The PMT output was connected to a lock-in amplifier for signal processing. We performed a melting curve analysis of a short dsDNA – SYBR Green I complex with a known melting temperature (TM) in a flow-through configuration without gradient to verify the functionality of proposed detection system. We then used the segmented flow configuration and measured the fluorescence amplitude of a droplet exposed to ∇T of ≈ 2.31°C mm-1. The proposed platform can be used as a fast and cost-effective system for performing either MCA of dsDNAs or for measuring protein unfolding for drug-screening applications.

Druh

G_funk - Funkční vzorek

CEP obor

—

OECD FORD obor

21002 - Nano-processes (applications on nano-scale); (biomaterials to be 2.9)

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2019

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

Optofluidní čip

Číselná identifikace

160867

Technické parametry

Velikost křemíkového čipu je 6 x 27 mm. Velikost kanálu je 500 um. Teplotní gradient na čipu je 2.31°C mm-1. Laser (470 nm) 1W snížen na 25 mW.

Ekonomické parametry

Náklady na výrobu a optický systém lze odhanout na více než 50 tisíc korun.

Kategorie aplik. výsledku dle nákladů

—

IČO vlastníka výsledku

—

Název vlastníka

oddělení-MEL-SIX

Stát vlastníka

CZ - Česká republika

Druh možnosti využití

A - K využití výsledku jiným subjektem je vždy nutné nabytí licence

Požadavek na licenční poplatek

A - Poskytovatel licence na výsledek požaduje licenční poplatek

Adresa www stránky s výsledkem

—