EnzymeMiner: automated mining of soluble enzymes with diverse structures, catalytic properties and stabilities

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26230%2F20%3APR34228" target="_blank" >RIV/00216305:26230/20:PR34228 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://loschmidt.chemi.muni.cz/enzymeminer/" target="_blank" >https://loschmidt.chemi.muni.cz/enzymeminer/</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

EnzymeMiner: automated mining of soluble enzymes with diverse structures, catalytic properties and stabilities

Popis výsledku v původním jazyce

EnzymeMiner prioritizes sequences that are more likely to preserve the catalytic activity and are heterologously expressible in a soluble form in Escherichia coli. The solubility prediction employs the in-house SoluProt predictor developed using machine learning. EnzymeMiner reduces the time devoted to data gathering, multi-step analysis, sequence prioritization and selection from days to hours. The successful use case for the haloalkane dehalogenase family is described in a comprehensive tutorial available on the EnzymeMiner web page. EnzymeMiner is a universal tool applicable to any enzyme family that provides an interactive and easy-to-use web interface freely available at https://loschmidt.chemi.muni.cz/enzymeminer/.

Název v anglickém jazyce

EnzymeMiner: automated mining of soluble enzymes with diverse structures, catalytic properties and stabilities

Popis výsledku anglicky

EnzymeMiner prioritizes sequences that are more likely to preserve the catalytic activity and are heterologously expressible in a soluble form in Escherichia coli. The solubility prediction employs the in-house SoluProt predictor developed using machine learning. EnzymeMiner reduces the time devoted to data gathering, multi-step analysis, sequence prioritization and selection from days to hours. The successful use case for the haloalkane dehalogenase family is described in a comprehensive tutorial available on the EnzymeMiner web page. EnzymeMiner is a universal tool applicable to any enzyme family that provides an interactive and easy-to-use web interface freely available at https://loschmidt.chemi.muni.cz/enzymeminer/.

Druh

R - Software

CEP obor

—

OECD FORD obor

20206 - Computer hardware and architecture

Projekt

—

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2020

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

EnzymeMiner

Technické parametry

Pro informace o licenčních podmínkách prosím kontaktujte: Mgr. Radka Báčová, Výzkumné centrum informačních technologií, Fakulta informačních technologií VUT v Brně, Božetěchova 2, 612 66 Brno, 541 141 473.

Ekonomické parametry

EnzymeMiner je poskytován jako nezisková webová služba pro vědeckou komunitu.

IČO vlastníka výsledku

—

Název vlastníka

Fakulta informačních technologií