High resolution melting analysis for identification of strains beloging to the Lactobacillus casei group
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26310%2F18%3APU127970" target="_blank" >RIV/00216305:26310/18:PU127970 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
High resolution melting analysis for identification of strains beloging to the Lactobacillus casei group
Popis výsledku v původním jazyce
Molecular methods based on the amplification of 16S ribosomal RNA gene analysis are more rapid, reliable, and reproducible and have greater sensitivity. High resolution melting (HRM) curve analysis is a simple, low-cost, closed tube method for amplicon discrimination and easy connection with real-time polymerase chain reaction (PCR). In this contribution, we report rapid species identification of strains belonging to the Lactobacillus casei group using HRM-PCR. Three different DNA isolation methods were used in this work: phenol extraction, separation using magnetic particles and commercial kit. Two sets of targeted gene fragments primers (groEL, BSH) were tested for amplification of the 16S rRNA gene. Use of groEL primers pair successfully identify strains belong to the Lactobacillus casei group. The variance between used extraction methods for evidence of HRM curves was found.
Název v anglickém jazyce
High resolution melting analysis for identification of strains beloging to the Lactobacillus casei group
Popis výsledku anglicky
Molecular methods based on the amplification of 16S ribosomal RNA gene analysis are more rapid, reliable, and reproducible and have greater sensitivity. High resolution melting (HRM) curve analysis is a simple, low-cost, closed tube method for amplicon discrimination and easy connection with real-time polymerase chain reaction (PCR). In this contribution, we report rapid species identification of strains belonging to the Lactobacillus casei group using HRM-PCR. Three different DNA isolation methods were used in this work: phenol extraction, separation using magnetic particles and commercial kit. Two sets of targeted gene fragments primers (groEL, BSH) were tested for amplification of the 16S rRNA gene. Use of groEL primers pair successfully identify strains belong to the Lactobacillus casei group. The variance between used extraction methods for evidence of HRM curves was found.
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
—
OECD FORD obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2018
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
Študentská vedecká konferencia PriF UK 2018 Zborník recenzovaných príspevkov
ISBN
978-80-223-4517-0
ISSN
—
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
1652
Strana od-do
302-307
Název nakladatele
Neuveden
Místo vydání
Neuveden
Místo konání akce
Bratislava
Datum konání akce
25. 4. 2018
Typ akce podle státní příslušnosti
EUR - Evropská akce
Kód UT WoS článku
—