Real-time PCR detekce viru Tomato ringspot virus (ToRSV) v biologickém materiálu

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F21%3AN0000151" target="_blank" >RIV/25271121:_____/21:N0000151 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Real-time PCR detekce viru Tomato ringspot virus (ToRSV) v biologickém materiálu

Popis výsledku v původním jazyce

Cílem této certifikované metodiky bylo zavedení metody detekce viru Tomato ringspot virus (ToRSV) na principu real-time PCR, která bude využita pro verifikaci nálezů ToRSV získaných jinou diagnostickou metodou, např. ELISA. Dalším cílem metodiky bylo porovnání obou postupů při detekci ToRSV. Navržený detekční systém na principu real-time PCR byl validován pro použití s cyklerem Rotor-Gene Q (Qiagen) dle validačního schématu EPPO PM 7/98 (4) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. Využití detekčního systému se předpokládá zejména pro rutinní diagnostiku viru při certifikaci rozmnožovacího materiálu, dále pak pro využití ve virologických laboratořích v základním či aplikovaném výzkumu.

Název v anglickém jazyce

Real-time PCR detection of Tomato ringspot virus (ToRSV) in biological material

Popis výsledku anglicky

The aim of this methodology is to implement a new detection system for Tomato ringspot virus (ToRSV) based on the principle of real-time PCR, which will be used to verify the findings of ToRSV obtained by another diagnostic method, such as ELISA. Another aim of the methodology is to compare both methods in the detection of ToRSV. The detection system was validated with the use of Rotor-Gene Q cycler (Qiagen) according to the validation scheme EPPO (European and Mediterranean Plant Protection Organization) PM7/98(4) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. The detection system may be preferably used for routine diagnostics of ToRSV during the certification procedure of propagation materials and for research purposes.

Druh

N_metC - Metodiky certifikované oprávněným orgánem

CEP obor

—

OECD FORD obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

Projekt

<a href="/cs/project/TJ02000159" target="_blank" >TJ02000159: Vývoj a validace souprav pro diagnostiku vybraných rostlinných virů</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

978-80-87030-80-6

Číslo předpisu

UKZUZ 019932/2021

Technické parametry

Osvědčení pod č.j. UKZUZ 019932/2021 o uznání uplatněné certifikované metodiky vydal Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědělský, Brno. Smlouva o využití výsledku uživatelem byla uzavřena s ÚKZÚZ.

Ekonomické parametry

Vzhledem k tomu, že je ToRSV karanténní virus, je potřeba, aby byl virus v co nejkratším čase spolehlivě detekován. To právě zajišťuje metoda na principu real-time PCR, která je oproti v současné době nejvíce používané metodě ELISA citlivější a rychlejší (hodiny versus dny). Navíc v případě použití ELISA souprav od firmy Bioreba je nutné pro detekci ToRSV použít obě dodávané soupravy – standardní a pro detekci kmenů ToRSV-Ch – což analytický proces dále prodlužuje. V případě testování ToRSV je rychlost velice důležitým parametrem, protože v případě pozitivních náletů je nutné, aby mohly být co nejdříve zahájeny příslušné kroky k nápravě ze strany státní správy. Rychlejší odezva laboratoře bude mít též pozitivní dopad na ekonomiku žadatele o vyšetření zdravotního stavu rostlin, neboť může získat výsledky v kratším čase, a tak pružněji reagovat na obdržené výsledky.

Označení certifikačního orgánu

Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědelský, Hroznová 2, 656 06, Brno

Datum certifikace

—

Způsoby využití výsledku

C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů