Nové metody detekce virů infikujících rostliny rodu Rubus – ověření v diagnostické praxi

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F24%3AN0000006" target="_blank" >RIV/25271121:_____/24:N0000006 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://vpovsuo.cz/wp-content/uploads/2024/05/1-Valentova_VPO-30_1_24-.pdf" target="_blank" >https://vpovsuo.cz/wp-content/uploads/2024/05/1-Valentova_VPO-30_1_24-.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.60702/0p68-7386" target="_blank" >10.60702/0p68-7386</a>

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Nové metody detekce virů infikujících rostliny rodu Rubus – ověření v diagnostické praxi

Popis výsledku v původním jazyce

Viry infikující rostliny rodu Rubus se řadí mezi patogeny, které mohou pěstitelům způsobovat významné hospodářské ztráty. Protože není k dispozici účinná léčba, je nutné vysazovat zdravý rozmnožovací materiál, a tím tak preventivně zabránit jejich šíření. Pro testování rostlinného materiálu rodu Rubus byly v multiplexním uspořádání vyvinuty detekční systémy na principu real-time PCR pro diagnostiku známých virů Black raspberry necrosis virus (BRNV), Raspberry ringspot virus (RpRSV), Raspberry bushy dwarf virus (RBDV), Strawberry latent ringspot virus (SLRSV), Rubus yellow net virus (RYNV) a nově objevených virů Raspberry rubodvirus 1 (RaRV1) a Raspberry enamovirus 1 (RaEV1). Cílem práce bylo ověřit funkčnost těchto systémů na vzorcích pocházejících z živých rostlin a z výsledků testování vyhodnotit zastoupení jednotlivých virů v pěti kategoriích, které odpovídaly různému původu vzorků získaných na území České republiky. Z výsledků testování vyplývá, že z celkového počtu 297 testovaných vzorků byla v 72 % rostlin prokázána infekce buď jediným virem nebo koinfekce více virů. Nejčastěji vyskytujícím se virem byl RYNV, který byl nalezen v 51 % testovaných rostlin.

Název v anglickém jazyce

New methods for the detection of viruses infecting Rubus plants – verification in diagnostic practice

Popis výsledku anglicky

Viruses infecting plants of the genus Rubus are among the pathogens that can cause significant economic losses to growers. As there is no effective treatment, it is necessary to plant healthy propagation material to prevent their spreading. To test plant material of the genus Rubus, real-time PCR-based multiplex detection systems have been developed for the diagnostics of known viruses: Black raspberry necrosis virus (BRNV), Raspberry ringspot virus (RpRSV), Raspberry bushy dwarf virus (RBDV), Strawberry latent ringspot virus (SLRSV), Rubus yellow net virus (RYNV); and the newly discovered Raspberry rubodvirus 1 (RaRV1) and Raspberry enamovirus 1 (RaEV1). The aim of the work was to verify the functionality of these systems on samples from living plants and to evaluate the presence of each virus in five categories corresponding to different origins of samples obtained in the Czech Republic. The results of the testing show that out of a total of 297 samples tested, 72 % of the plants were found to be infected with either a single virus or co-infected with multiple viruses. The most frequently occurring virus was RYNV, which was found in 51 % of the plants tested.

Druh

J_ost - Ostatní články v recenzovaných periodicích

CEP obor

—

OECD FORD obor

10607 - Virology

Projekt

<a href="/cs/project/TO01000295" target="_blank" >TO01000295: Zdravé ovoce v měnících se klimatických podmínkách: vývoj nových biotechnologických postupů diagnostiky virů, studium vektorů, ozdravování a bezpečného uchovávání jahodníku a maliníku</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2024

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Vědecké práce ovocnářské

ISSN

—

e-ISSN

2695-1347

Svazek periodika

30

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

11

Strana od-do

1-11

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—