Genetická diverzita izolátů Pyrenophora teres zjištěná analýzou AFLP

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25328859%3A_____%2F05%3A%230000032" target="_blank" >RIV/25328859:_____/05:#0000032 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00027006:_____/05:219

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Genetic diversity of Pyrenophora teres isolates as detected by AFLP analysis

Popis výsledku v původním jazyce

Amplified fragment length polymorphism (AFLP) analysis has been used to analyse mainly 83 Czech isolates of Pyrenophora teres, P. graminea, P. tritici-repentis and Helminthosporium sativum. Each species had distinct AFLP profiles. Using 19 primer combinations 948 polymorphic bands were detected. All main clusters in dendrogram correspond to the studied species. Even the two forms of P. teres-P. teres f. teres (PTT) and P. teres f. maculata (PTM) - formed different clusters. Genetic diversity, with regard to the locality and the year of the sample's collection, was analysed separately within the AFLP-based dendrogram cluster of PTT and PTM. Unweighted pair-group method (UPGMA) analysis of the 37 isolates of PTT and 30 isolates of PTM, using 469 polymorphic bands, showed that the variability seemed to be influenced more by the year of sampling than by the geographic origin of the isolate.

Název v anglickém jazyce

Genetic diversity of Pyrenophora teres isolates as detected by AFLP analysis

Popis výsledku anglicky

Amplified fragment length polymorphism (AFLP) analysis has been used to analyse mainly 83 Czech isolates of Pyrenophora teres, P. graminea, P. tritici-repentis and Helminthosporium sativum. Each species had distinct AFLP profiles. Using 19 primer combinations 948 polymorphic bands were detected. All main clusters in dendrogram correspond to the studied species. Even the two forms of P. teres-P. teres f. teres (PTT) and P. teres f. maculata (PTM) - formed different clusters. Genetic diversity, with regard to the locality and the year of the sample's collection, was analysed separately within the AFLP-based dendrogram cluster of PTT and PTM. Unweighted pair-group method (UPGMA) analysis of the 37 isolates of PTT and 30 isolates of PTM, using 469 polymorphic bands, showed that the variability seemed to be influenced more by the year of sampling than by the geographic origin of the isolate.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/QC1361" target="_blank" >QC1361: Vývoj metody pro kvantifikaci houbových patogenů na bázi RealTime PCR</a><br>

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2005

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal of Phytopathology

ISSN

0931-1785

e-ISSN

—

Svazek periodika

153

Číslo periodika v rámci svazku

10

Stát vydavatele periodika

DE - Spolková republika Německo

Počet stran výsledku

10

Strana od-do

569-578

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—