Identifikace hybridů kukuřice s využitím molekulárních technik RAPD a SSR

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F26296080%3A_____%2F11%3A%230000313" target="_blank" >RIV/26296080:_____/11:#0000313 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Identifikace hybridů kukuřice s využitím molekulárních technik RAPD a SSR

Popis výsledku v původním jazyce

Abstrakt Důležitou součástí šlechtitelského procesu je detailní znalost genetické diversity a vztahů mezi hybridy kukuřice. Hlavním cílem bylo (1) s využitím RAPD a SSR markerů odhadnout genetickou diverzitu mezi 30 hybridy kukuřice a (2) porovnat genetické hodnoty získané z těchto markrovacích systémů. Byl hodnocen soubor 30 hybridů kukuřice. Z důvodu srovnání dvou odlišných metod byly spočítány genetické parametry, tj. počet polymorfních bandů, průměrný počet alel na lokus, efektivní počet alel na lokus (Ne), očekávaná heterozygotnost (H), index účinnosti a polymorfní informační obsah (PIC). Lepší výsledky byly dosaženy v případě SSR markerů. SSR systém poskytl průměrnú hodnotu PIC 0,71 (v rozsahu od 0,47 do 0,91), v případě RAPD byla průměrná hodnota 0,61 (v rozsahu od 0,44 do 0,82). Genetická podobnost (GS) byla pro SSR vypočtena pomocí koeficientu Nei&Li, v případě RAPD byl použit podobnostní koeficient Jaccard. Pro SSR systém se hodnota GS pohybovala v rozmezí od 26,3% do 88,5% (

Název v anglickém jazyce

Random amplified polymorphic DNA (RAPD) and simple sequence repeat (SSR) marker efficacy for maize hybrid identification

Popis výsledku anglicky

Knowledge as to genetic diversity and relationships among maize hybrids is important for breeding strategies. The main aims of this study were to (1) estimate molecular genetic diversity among 30 maize hybrids by random amplified polymorphic DNA (RAPD) and simple sequence repeat (SSR) markers; and (2) compare the genetic relatedness values obtained from these marker types. A set of 30 maize hybrids was assessed. To compare these two methods, genetic parameters were computed such as the number of polymorphic bands, average number of alleles per locus, effective number of alleles per locus, expected heterozygosity, effectiveness index of analysis and polymorphism information content (PIC). Better results were provided by SSR. The discrimination ability of individual markers was also determined. The SSR system provided an average PIC of 0.71 (ranging from 0.47 to 0.91) and RAPD provided an average value of 0.61 (ranging from 0.44 to 0.82). Genetic similarities (GS) were estimated using Ne

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2011

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

African Journal of Biotechnology

ISSN

1684-5315

e-ISSN

—

Svazek periodika

24

Číslo periodika v rámci svazku

10

Stát vydavatele periodika

NE - Nigerijská federativní republika

Počet stran výsledku

8

Strana od-do

4797-4801

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—