Optimalizace metody loop-mediated isothermal amplification pro detekci bakterie Xanthomonas vesicatoria
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60076658%3A12220%2F16%3A43892028" target="_blank" >RIV/60076658:12220/16:43892028 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Optimalizace metody loop-mediated isothermal amplification pro detekci bakterie Xanthomonas vesicatoria
Popis výsledku v původním jazyce
Předmětem této práce je využití metody loop-mediated isothermal amplification (LAMP) pro polní detekci bakterie Xanthomonas vesicatoria, která způsobuje bakteriální skvrnitost rajčat a paprik. V průběhu optimalizace metody bylo vybráno 10 genových sekvencí, u kterých probíhal samotný návrh pomocí softwaru PrimerExplorer verze 5. Z navržených primerů bylo několik sad vybráno do laboratorního testování. Na základě provedených experimentů byla navržena jedna sada primerů s názvem XvefP, která byla dále syntetizována a optimalizována pro rutinní detekci X. vesicatoria metodou LAMP.
Název v anglickém jazyce
Optimization methods loop-mediated isothermal amplification to detect the bacteria Xanthomonas vesicatoria
Popis výsledku anglicky
The subject of study is application loop-mediated isothermal amplification method for field detection of the Xanthomonas vesicatoria causing bacterial spot of tomato and pepper. Ten gene suquences have been designed using PrimerExplorer version 5.One primer set XvefP has been chosen to be optimized for LAMP detection od X. vesicatoria. XvefP is the first primer set for detection X. vesicatoria using LAMP method.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2016
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Úroda
ISSN
0139-6013
e-ISSN
—
Svazek periodika
12
Číslo periodika v rámci svazku
LXIV
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
4
Strana od-do
281-284
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—