Current standard assays using artificial substrates overestimate phosphodiesterase activity

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60076658%3A12310%2F13%3A43885615" target="_blank" >RIV/60076658:12310/13:43885615 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://ac.els-cdn.com/S0038071712000600/1-s2.0-S0038071712000600-main.pdf?_tid=64502ab6-840b-11e3-9277-00000aab0f6c&acdnat=1390467201_dd136a4b5fbbfc9681510c516fb23042" target="_blank" >http://ac.els-cdn.com/S0038071712000600/1-s2.0-S0038071712000600-main.pdf?_tid=64502ab6-840b-11e3-9277-00000aab0f6c&acdnat=1390467201_dd136a4b5fbbfc9681510c516fb23042</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.soilbio.2012.02.008" target="_blank" >10.1016/j.soilbio.2012.02.008</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Current standard assays using artificial substrates overestimate phosphodiesterase activity

Popis výsledku v původním jazyce

Phosphodiesterases (PDE) are important enzymes in environments with significant proportion of phosphodiesters. The breakdown of phosphodiesters is a two step process, initiated by PDE hydrolyzing an ester-P bond on the diester molecule, breaking it intoan organic moiety and a phosphomonoester. In the second step, the phosphomonoester is further hydrolyzed by phosphomonoesterase (PME) into the second organic moiety and free phosphate, P-i. The methods to assess extracellular PDE activities commonly usethe substrate analogues bis-(p-nitrophenyl) phosphate (bis-pNPP) or bis-(4-methylumbelliferyl) phosphate (bis-MUFP), measure the resulting concentration of p-nitrophenol (pNP) or 4-methylumbelliferon (MUF), and assume the contribution from phosphomonoester hydrolysis by PME to be insignificant. To verify this, we measured concentrations of MUF and P-i at the end of the 30- and 60-min incubation of wetland plant root segments with a phosphodiester substrate. We found that the hydrolysis w

Název v anglickém jazyce

Current standard assays using artificial substrates overestimate phosphodiesterase activity

Popis výsledku anglicky

Phosphodiesterases (PDE) are important enzymes in environments with significant proportion of phosphodiesters. The breakdown of phosphodiesters is a two step process, initiated by PDE hydrolyzing an ester-P bond on the diester molecule, breaking it intoan organic moiety and a phosphomonoester. In the second step, the phosphomonoester is further hydrolyzed by phosphomonoesterase (PME) into the second organic moiety and free phosphate, P-i. The methods to assess extracellular PDE activities commonly usethe substrate analogues bis-(p-nitrophenyl) phosphate (bis-pNPP) or bis-(4-methylumbelliferyl) phosphate (bis-MUFP), measure the resulting concentration of p-nitrophenol (pNP) or 4-methylumbelliferon (MUF), and assume the contribution from phosphomonoester hydrolysis by PME to be insignificant. To verify this, we measured concentrations of MUF and P-i at the end of the 30- and 60-min incubation of wetland plant root segments with a phosphodiester substrate. We found that the hydrolysis w

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

DF - Pedologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/ME%20912" target="_blank" >ME 912: Propojení procesů a struktury společenstva ekosystémů tropických mokřadů: role makrofytů a mikrobiálních společenstev</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2013

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Soil Biology & Biochemistry

ISSN

0038-0717

e-ISSN

—

Svazek periodika

56

Číslo periodika v rámci svazku

JAN 2013

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

75-79

Kód UT WoS článku

000313153600013

EID výsledku v databázi Scopus

—