FlowRec

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60076658%3A12520%2F20%3A43901551" target="_blank" >RIV/60076658:12520/20:43901551 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://auc.cz/software/2020.php#FlowRec" target="_blank" >http://auc.cz/software/2020.php#FlowRec</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

FlowRec

Popis výsledku v původním jazyce

Algoritmus umožňuje ze sekvence snímků nebarvené savčí buňky získat výpočtem rychlostních polí informaci o vnitrobuněčných tocích. Základem metody je detekce příznaků metodou SURF, z nichž je vytvořena trajektorie. Dvě složky pohybu – přímá a Brownova – jsou odděleny originální metodou založenou na odhadu minimální kovariance. Brownova složka dává prostorově rozlišený difúzní koeficient. Z přímé složky lze vypočítat rychlostní pole a, pomocí Stokesovy rovnice, odhad prostorově distribuované efektivní viskozity.

Název v anglickém jazyce

FlowRec

Popis výsledku anglicky

The algorithm allows to squeeze the information on the intracellular flows by reconstruction of intracellular flow velocity fields based only on a recorded video of an unstained mammalian cell. The basis of the method is detection of speeded-up robust features (SURF) and assembling them into trajectories. Two components of motion – direct and Brownian – are separated by an original method based on minimum covariance estimation. The Brownian component gives a spatially resolved diffusion coefficient. The directed component yields a velocity field, and, after fitting the vorticity equation, estimation of the spatially distributed effective viscosity.

Druh

R - Software

CEP obor

—

OECD FORD obor

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Projekt

—

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2020

Kód důvěrnosti údajů

C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.

Interní identifikační kód produktu

FlowRec

Technické parametry

Více na http://www.auc.cz/software/doc/FlowRec.pdf. Osoba odpovědná pro jednání: Ing. Renata Rychtáriková, FROV JČU, Zámek 136, 373 33 Nové Hrady, email: rrychtarikova@frov.jcu.cz, telefon: +420 38777 3833

Ekonomické parametry

Jako součást mikroskopu NanoTruth je předpokládaný zisk jednotky mil. EUR/rok.

IČO vlastníka výsledku

60076658

Název vlastníka

Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích