Detekce bakterií a archeí v půdě a v sedimentech pomocí metody CARD-FISH

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F10%3A00350624" target="_blank" >RIV/60077344:_____/10:00350624 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Detekce bakterií a archeí v půdě a v sedimentech pomocí metody CARD-FISH

Popis výsledku v původním jazyce

Pomocí metody CARD-FISH (catalyzed reporter deposition ? fluorescence in situ hybridization) bylo detekováno mikrobiální zastoupení archeí, bakterií a aktinobakterií ve třech významně odlišných prostředích: v půdě podhorské pastviny, v netopýřím guánu zjeskyně a v miocenním sedimentu. V těchto rozdílných substrátech byly z naměřených dat vyhodnoceny rozdíly v mikrobiálním společenstvu a výsledky byly porovnány s celkovým počtem bakterií (DAPI) a počtem kolonií bakterií (CFU). V půdě podhorských pastvinrostl počet bakterií a archeí, stanovených pomocí CARD-FISH metody, s mírou zatížení půdy pastvou skotu. Tento trend potvrzovaly i celkové počty buněk (DAPI) a stanovení počtu CFU buněk. Nejvyšší počty bakterií a archeí v gramu suché půdy byly na plošenejvíce ovlivněné pobytem skotu (3,97 x 109 resp. 3,62 x 108) a nejnižší na kontrolní ploše bez vlivu zvířat (0,55 x 109 resp. 0,35 x 108).

Název v anglickém jazyce

Detection of bacteria and archaea in soil and sediments using CARD-FISH method

Popis výsledku anglicky

The CARD-FISH (catalyzed reporter deposition - fluorescence in situ hybridization) method together with total bacterial counts (DAPI), colony forming units (CFU) and culturable-to-total (C/T) cell ratio was used to determine the prokaryotic community composition in three different types of samples: upland pasture soil, bat guano from cave and Miocene sediment. The occurrence of Archaea, Bacteria and major bacterial group Actinobacteria were studied using CARD-FISH analysis. In upland pasture soil, all quantitative characteristics (CARD-FISH-stained archeal and bacterial cells, DAPI, CFU and index C/T) increased considerably with the degree of animal impact. Absolute values for Bacteria, Archaea ranged from 0.55 x 109 to 3.97 x 109 cells g-1 dry soil and from 0.35 x 108 to 3.62 x 108 cells g-1 dry soil, respectively, being the highest at severe impacted site and the lowest at control soil.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EH - Ekologie – společenstva

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2010

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Život v pôde XI. Zborník z medzinárodného seminára

ISBN

978-80-223-2796-1

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

17

Strana od-do

—

Název nakladatele

Vydavateľstvo Univerzity Komenského

Místo vydání

Bratislava

Místo konání akce

Bratislava

Datum konání akce

26. 1. 2010

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—