Využití metody CARD-FISH pro studium složení mikrobiálního společenstva
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F10%3A00374982" target="_blank" >RIV/60077344:_____/10:00374982 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Využití metody CARD-FISH pro studium složení mikrobiálního společenstva
Popis výsledku v původním jazyce
Metodou CARD-FISH bylo úspěšně detekováno mikrobiální zastoupení skupin prokaryot (Doména: Archea a Bakterie, Kmen: Aktinobakterie) ve třech odlišných prostředích: v půdě podhorské pastviny, v netopýřím guánu a v miocénnim jílovém sedimentu. Počet bakterií a archeí v mikrobiálním společenstvu půdy podhorské pastviny stanovený pomocí CARD-FISH metody klesá se snižujícím se vlivem zvířat. Poměr kultivovatelných buněk k celkovému počtu buněk (index C/T) se významně zvyšoval s mírou zatížení půd pastvou skotu. Byl prokázán vliv stáří netopýřího guána na množství biomasy archeí i bakterií. V mikrobiálním společenstvu miocénního sedimentu byla zjištěna dominance kmene Aktinobakterie, naopak Archea nebyly detekovány.
Název v anglickém jazyce
The usage of CARD-FISH method for study of microbial community composition
Popis výsledku anglicky
The CARD-FISH (catalyzed reporter deposition ? fluorescence in situ hybridization) method together with total bacterial counts (DAPI), colony forming units (CFU) and culturable-to ?total (C/T) cell ratio was used to determine the prokaryotic community composition in three different types of samples: upland pasture soil, bat guano from cave and Miocene sediment. The occurrence of Archaea, Bacteria and major bacterial group Actinobacteria were studied using CARD-FISH analysis. In upland pasture soil, allquantitative characteristics (CARD-FISH-stained archeal and bacterial cells, DAPI, CFU and index C/T) increased considerably with the degree of animal impact. Absolute values for Bacteria and Archaea ranged from 0.55x109 to 3.97x109 cells g-1 dry soil and from 0.35x108 to 3.62x108 cells g-1 dry soil, respectively, being the highest at severe impacted site and the lowest at control soil.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EH - Ekologie – společenstva
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2010
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Phytopedon
ISSN
1336-1120
e-ISSN
—
Svazek periodika
9
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
SK - Slovenská republika
Počet stran výsledku
7
Strana od-do
6-12
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—