Biological and molecular analysis of the pathogenic variant C3 of potato spindle tuber viroid (PSTVd) evolved during adaptation to chamomile (Matricaria chamomilla)
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F12%3A00381545" target="_blank" >RIV/60077344:_____/12:00381545 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/60076658:12310/12:43883615
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1515/hsz-2011-0286" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1515/hsz-2011-0286</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1515/hsz-2011-0286" target="_blank" >10.1515/hsz-2011-0286</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Biological and molecular analysis of the pathogenic variant C3 of potato spindle tuber viroid (PSTVd) evolved during adaptation to chamomile (Matricaria chamomilla)
Popis výsledku v původním jazyce
Viroid-caused pathogenesis is a speci?c process dependent on viroid and host genotype(s), and may involve viroid-speci?c small RNAs (vsRNA). We describe a new PSTVd variant C3, evolved through sequence adaptation to the host chamomile, causing extraordinary severe symptoms. The symptoms and the vsRNA pool of PSTVd-C3 were compared to those of severe variant PSTVd-AS1, from which PSTVd-C3 differs by 5 mutations within the P domain. PSTVd-C3 and -AS1 caused similar symptoms on chamomile, tomato, and Nicotiana benthamiana, including a block of lignin biosynthesis in roots of cultured chamomile and tomato. These strains exhibited similar but species-speci?c distributions of selected vsRNAs, as quanti?ed using TaqMan probes, with higher stability and lowervariation in analyzed vsRNA pools than the mild PSTVd-QFA. Strong downregulation of four selected expression markers? (TCP3, CIPK, VSF-1, and VPE) was detected in tomato leaf blades infected by PSTVd-C3- and -AS1 but not by PSTVd-QFA.
Název v anglickém jazyce
Biological and molecular analysis of the pathogenic variant C3 of potato spindle tuber viroid (PSTVd) evolved during adaptation to chamomile (Matricaria chamomilla)
Popis výsledku anglicky
Viroid-caused pathogenesis is a speci?c process dependent on viroid and host genotype(s), and may involve viroid-speci?c small RNAs (vsRNA). We describe a new PSTVd variant C3, evolved through sequence adaptation to the host chamomile, causing extraordinary severe symptoms. The symptoms and the vsRNA pool of PSTVd-C3 were compared to those of severe variant PSTVd-AS1, from which PSTVd-C3 differs by 5 mutations within the P domain. PSTVd-C3 and -AS1 caused similar symptoms on chamomile, tomato, and Nicotiana benthamiana, including a block of lignin biosynthesis in roots of cultured chamomile and tomato. These strains exhibited similar but species-speci?c distributions of selected vsRNAs, as quanti?ed using TaqMan probes, with higher stability and lowervariation in analyzed vsRNA pools than the mild PSTVd-QFA. Strong downregulation of four selected expression markers? (TCP3, CIPK, VSF-1, and VPE) was detected in tomato leaf blades infected by PSTVd-C3- and -AS1 but not by PSTVd-QFA.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GCP501%2F10%2FJ018" target="_blank" >GCP501/10/J018: Pospiviroidní patogeneze jako regulační porucha zprostředkovaná malými viroid-specifickými RNA.</a><br>
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2012
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Biological Chemistry
ISSN
1431-6730
e-ISSN
—
Svazek periodika
393
Číslo periodika v rámci svazku
7
Stát vydavatele periodika
DE - Spolková republika Německo
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
605-615
Kód UT WoS článku
000307087600007
EID výsledku v databázi Scopus
—