Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Genome sequence and silkomics of the spindle ermine moth, Yponomeuta cagnagella, representing the early diverging lineage of the ditrysian Lepidoptera

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F22%3A00564417" target="_blank" >RIV/60077344:_____/22:00564417 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/68378050:_____/22:00564417 RIV/60076658:12310/22:43905072

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.nature.com/articles/s42003-022-04240-9.pdf" target="_blank" >https://www.nature.com/articles/s42003-022-04240-9.pdf</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/s42003-022-04240-9" target="_blank" >10.1038/s42003-022-04240-9</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Genome sequence and silkomics of the spindle ermine moth, Yponomeuta cagnagella, representing the early diverging lineage of the ditrysian Lepidoptera

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Many lepidopteran species produce silk, cocoons, feeding tubes, or nests for protection from predators and parasites for caterpillars and pupae. Yet, the number of lepidopteran species whose silk composition has been studied in detail is very small, because the genes encoding the major structural silk proteins tend to be large and repetitive, making their assembly and sequence analysis difficult. Here we have analyzed the silk of Yponomeuta cagnagella, which represents one of the early diverging lineages of the ditrysian Lepidoptera thus improving the coverage of the order. To obtain a comprehensive list of the Y. cagnagella silk genes, we sequenced and assembled a draft genome using Oxford Nanopore and Illumina technologies. We used a silk-gland transcriptome and a silk proteome to identify major silk components and verified the tissue specificity of expression of individual genes. A detailed annotation of the major genes and their putative products, including their complete sequences and exonintron structures is provided. The morphology of silk glands and fibers are also shown. This study fills an important gap in our growing understanding of the structure, evolution, and function of silk genes and provides genomic resources for future studies of the chemical ecology of Yponomeuta species.

  • Název v anglickém jazyce

    Genome sequence and silkomics of the spindle ermine moth, Yponomeuta cagnagella, representing the early diverging lineage of the ditrysian Lepidoptera

  • Popis výsledku anglicky

    Many lepidopteran species produce silk, cocoons, feeding tubes, or nests for protection from predators and parasites for caterpillars and pupae. Yet, the number of lepidopteran species whose silk composition has been studied in detail is very small, because the genes encoding the major structural silk proteins tend to be large and repetitive, making their assembly and sequence analysis difficult. Here we have analyzed the silk of Yponomeuta cagnagella, which represents one of the early diverging lineages of the ditrysian Lepidoptera thus improving the coverage of the order. To obtain a comprehensive list of the Y. cagnagella silk genes, we sequenced and assembled a draft genome using Oxford Nanopore and Illumina technologies. We used a silk-gland transcriptome and a silk proteome to identify major silk components and verified the tissue specificity of expression of individual genes. A detailed annotation of the major genes and their putative products, including their complete sequences and exonintron structures is provided. The morphology of silk glands and fibers are also shown. This study fills an important gap in our growing understanding of the structure, evolution, and function of silk genes and provides genomic resources for future studies of the chemical ecology of Yponomeuta species.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10605 - Developmental biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2022

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Communications Biology

  • ISSN

    2399-3642

  • e-ISSN

    2399-3642

  • Svazek periodika

    5

  • Číslo periodika v rámci svazku

    1

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    13

  • Strana od-do

    1281

  • Kód UT WoS článku

    000887050100001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85137223171