Diagnóza viroidu vřetenovitosti hlíz bramboru molekulárně genetickými technikami (RT-PCR a RT-PCR v reálném čase)

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F06%3A%230000047" target="_blank" >RIV/60109807:_____/06:#0000047 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Diagnóza viroidu vřetenovitosti hlíz bramboru molekulárně genetickými technikami (RT-PCR a RT-PCR v reálném čase)

Popis výsledku v původním jazyce

Cílem vlastní práce bylo vybrat a optimalizovat rychlou a citlivou laboratorní metodu pro spolehlivou detekci tohoto karanténního onemocnění bramboru. Jako experimentální materiály byly využity 2 typové izoláty viroidní vřetenovitosti hlíz bramboru (PSTVd) ze sbírky virových a viroidních patogenů kat. č. VIRUBRA 7/001 a 7/002 vedené v in-vitro podmínkách. Naše práce porovnávala metody izolace NA pomocí magnetických částic (MagExtractor-RNA Kit - Toyobo) s využitím přístroje KingFisher mL a ?tradiční? postup tj. izolace NA pomocí komerčních souprav založených na specifické vazbě a následné eluci NA z nosičů umístěných ve speciálních kolonkách (RNeasy Plant Total RNA Kit - Qiagen). RNA byla extrahována z rostlin in vitro. Obě zkoušené metody poskytovalyRNA pro následnou RT-PCR bez zjištění vlivu přítomnosti rostlinných inhibitorů. Předností obou těchto metod je jejich malá časová náročnost a srovnatelná cena. Obě výše zmíněné techniky byly vhodné pro následnou RT-PCR.

Název v anglickém jazyce

Diagnosis of Potato spindle tuber viroid by means of molecular genetic techniques (RT-PCR and QRT-PCR)

Popis výsledku anglicky

The major aim of this work was to develope and evaluate rapid and sensitive method for the detection of PSTVd, because Potato spindle tuber viroid (PSTVd) is a quarantine pathogen in the European Union. According to the EU Plant Health directive 2000/29/EC, countries must be able to detect and identify this quarantine organism. Because viroids do not code for any protein, the RT-PCR or real-time RT-PCR assays are methods of choice suitable for large-scale testing. Also high throughput RNA isolation technique is needed for these tests. There were evaluated and adapted The EU protocol for this quarantine pathogen for the equipment in the laboratories of Potato Research Institute Havlíčkův Brod, Czech Republic. We used evaluated RT-PCR and QRT-PCR procedures for detecting of PSTVd in tested samples. All the samples tested were negative.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2006

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Sborník abstraktů XVII. České a slovenské konference o ochraně roslin

ISBN

80-213-1516-4

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

386

Strana od-do

37-39

Název nakladatele

ČZU Praha

Místo vydání

Praha

Místo konání akce

Praha

Datum konání akce

1. 1. 2006

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—