Akomodace postupu polymerázové řetězové reakce v reálném čase (QRT-PCR) pro detekci viroidu

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F07%3A%230000078" target="_blank" >RIV/60109807:_____/07:#0000078 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Akomodace postupu polymerázové řetězové reakce v reálném čase (QRT-PCR) pro detekci viroidu

Popis výsledku v původním jazyce

Polymerázová řetězová reakce využívající fluorescenční sondy nevyžaduje už žádné následné kroky a má mnoho výhod. Použití postupu pomáhá zrychlit a zlepšit diagnózu. Tato technika byla použita pro detekci důležitých virů bramboru a viroidu bramboru. Nejdůležitějším úkolem této práce bylo vyvinout a ověřit rychlou a citlivou metodu pro detekci PSTVd, protože viroid vřetenovitosti hlíz bramboru (PSTVd) je v Evropské unii karanténní patogen. Podle nařízení EU (Plant Health directive 2000/29/EC) musí být státy schopné detekovat a identifikovat tento karanténní organismus. Protože viroidy nekódují žádný protein, jsou RT-PCR nebo RT-PCR v reálném čase vhodnými k testování většího počtu vzorků. Protokol EU pro detekci tohoto karanténního patogena byl přizpůsoben a ověřen na vybavení v laboratořích Výzkumného ústavu bramborářského Havlíčkův Brod, Česká republika.

Název v anglickém jazyce

Accomodation of polymerase chain reaction technique (QRT-PCR) for the detection of PSTVd and some potato viruses

Popis výsledku anglicky

Polymerase chain reaction using fluorescent probes obviates any post-PCR steps and has many advantages. The use of this assay helps to speed up and improve the diagnosis. This technique were used for detection of important potato viruses and potato spindle tuber viroid. Most important task was of this work was to develope and evaluate rapid and sensitive method for the detection of PSTVd, because Potato spindle tuber viroid (PSTVd) is a quarantine pathogen in the European Union. According to the EU Plant Health directive 2000/29/EC, countries must be able to detect and identify this quarantine organism. Because viroids do not code for any protein, the RT-PCR or real-time RT-PCR assays are methods of choice suitable for large-scale testing. There were evaluated and adapted The EU protocol for this quarantine pathogen for the equipment in the laboratories of Potato Research Institute Havlíčkův Brod, Czech Republic.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2007

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Sborník příspěvků ze semináře s mezinárodní účastí ?Molekulární a technologické základy produkce kvlitních brambor?, Havlíčkův Brod 19.10. 2007. Vědecké práce ? Výzkumný ústav bramborářský Havlíčkův Brod, 15

ISSN

1802-940X

e-ISSN

—

Svazek periodika

15

Číslo periodika v rámci svazku

2007

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

183-188

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—