Molekulární metody detekce viriodu vřetenovitosti hlíz bramboru (Potato Spindle Tuber Viroid, PSTVd)
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F15%3A%230000335" target="_blank" >RIV/60109807:_____/15:#0000335 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Molekulární metody detekce viriodu vřetenovitosti hlíz bramboru (Potato Spindle Tuber Viroid, PSTVd)
Popis výsledku v původním jazyce
Pro detekci a diagnózu závažných patogenů zařazených do kategorie regulovaných (karanténních) organismů doporučuje EPPO (European and Mediterranean Plant Protection Organization) využívání vhodných diagnostických postupů. K nejcitlivějším jsou řazeny molekulární metody, zvláště PCR (Polymerase Chain Reaction). Cílem vlastní práce bylo ověření a aplikace inovovaných postupů qRT-PCR (SYBR Green, TaqMan ) a Luminex-xTAG pro detekci izolátů PSTVd v bramboru (Solanum tuberosum) a některých okrasných rostlinách (Solanum jasminoides, Brugmansia sp.). Oběma technikami qRT-PCR byly testované izoláty PSTVd spolehlivě detekovány. V postupu Luminex-xTAG byly zkoušené izoláty PSTVd rovněž specificky a spolehlivě identifikovány. Metoda Luminex-xTAG představuje novou metodu vhodnou pro detekci patogenů na molekulární úrovni s citlivostí srovnatelnou s qRT-PCR.
Název v anglickém jazyce
Molecular detection methods for Potato spindle tuber viroid (PSTVd)
Popis výsledku anglicky
EPPO (European and Mediterranean Plant Protection Organization) recommends the use of suitable diagnostic methods for the detection and diagnosis of serious pathogens included in the category of regulated (quarantine) organisms. Molecular methods, particularly PCR (Polymerase Chain Reaction) are classified as the most sensitive ones. The aim of the work was the verification and application of innovative techniques qRT-PCR (SYBR Green, TaqMan) and Luminex-xTag for detection of PSTVd isolates in potato (Solanum tuberosum) and some ornamental plants (Solanum jasminoides, Brugmansia sp.). PSTVd isolates were reliably detected by both methods of qRT-PCR. PSTVd isolates were also specifically and reliably detected by Luminex-xTAG technology. Method Luminex-xTAG presents a new method suitable for the detection of pathogens at the molecular level with a sensitivity comparable to qRT-PCR.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Úroda - Vědecká příloha
ISSN
0139-6013
e-ISSN
—
Svazek periodika
63
Číslo periodika v rámci svazku
12
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
4
Strana od-do
195-198
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—