Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Polymorphism of Bolivian accessions of Arachis hypogaea L. revealed by allergen coding DNA markers

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60460709%3A41340%2F23%3A96612" target="_blank" >RIV/60460709:41340/23:96612 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://pse.agriculturejournals.cz/artkey/pse-202312-0006_polymorphism-of-bolivian-accessions-of-arachis-hypogaea-l-revealed-by-allergen-coding-dna-markers.php" target="_blank" >https://pse.agriculturejournals.cz/artkey/pse-202312-0006_polymorphism-of-bolivian-accessions-of-arachis-hypogaea-l-revealed-by-allergen-coding-dna-markers.php</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.17221/306/2023-PSE" target="_blank" >10.17221/306/2023-PSE</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Polymorphism of Bolivian accessions of Arachis hypogaea L. revealed by allergen coding DNA markers

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Arachis hypogaea L. is an annual legume that is one of the most consumed plant species. On the other hand, it belongs to one of the most monitored clinically important allergens worldwide. The polymorphism of this species based on allergen coding genes could be useful in its characterisation, but previously, no allergen-based marker techniques have been developed for peanuts. A new type of DNA-based markers of coding regions were used to analyse the variability of 21 peanut accessions – BBAP (Bet v1 based amplicon polymorphism), PBAP (profilin based amplicon polymorphism), and VBAP (vicilin based amplicon polymorphism). All of the used technique provided polymorphic fingerprints and distinguished the analysed peanut accessions. The effectivity of these techniques corresponds to the presence of the allergen homologous sequences that are a part of the A. hypogaea genome. VBAP was the most effective in distinguishing the analysed peanut accessions when compared to the results of BBAP and PBAB. For BBAP, two of the analysed accessions provided the same fingerprinting pattern. The ability of the used markers to detect polymorphisms was comparable, with an average polymorphism information content (PIC) value of 0.47.

  • Název v anglickém jazyce

    Polymorphism of Bolivian accessions of Arachis hypogaea L. revealed by allergen coding DNA markers

  • Popis výsledku anglicky

    Arachis hypogaea L. is an annual legume that is one of the most consumed plant species. On the other hand, it belongs to one of the most monitored clinically important allergens worldwide. The polymorphism of this species based on allergen coding genes could be useful in its characterisation, but previously, no allergen-based marker techniques have been developed for peanuts. A new type of DNA-based markers of coding regions were used to analyse the variability of 21 peanut accessions – BBAP (Bet v1 based amplicon polymorphism), PBAP (profilin based amplicon polymorphism), and VBAP (vicilin based amplicon polymorphism). All of the used technique provided polymorphic fingerprints and distinguished the analysed peanut accessions. The effectivity of these techniques corresponds to the presence of the allergen homologous sequences that are a part of the A. hypogaea genome. VBAP was the most effective in distinguishing the analysed peanut accessions when compared to the results of BBAP and PBAB. For BBAP, two of the analysed accessions provided the same fingerprinting pattern. The ability of the used markers to detect polymorphisms was comparable, with an average polymorphism information content (PIC) value of 0.47.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    40101 - Agriculture

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2023

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Plant, Soil and Environment

  • ISSN

    1214-1178

  • e-ISSN

    1214-1178

  • Svazek periodika

    69

  • Číslo periodika v rámci svazku

    12

  • Stát vydavatele periodika

    CZ - Česká republika

  • Počet stran výsledku

    13

  • Strana od-do

    615-627

  • Kód UT WoS článku

    001127081800001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85180450786