Reaktivita histidinových a lysinových postranních řetězců s diethylpyrokarbonátem - metoda pro identifikaci povrchově dostupných zbytků v proteinech
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22330%2F08%3A00020949" target="_blank" >RIV/60461373:22330/08:00020949 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Reactivity of histidine and lysine side-chains with diethylpyrocarbonate - A method to identify surface exposed residues in proteins
Popis výsledku v původním jazyce
The chemical modification of amino acid side-chains followed by mass spectrometric detection can reveal at least partial information about the 3-D structure of proteins. In this work we tested diethylpyrocarbonate, as a common histidyl modification agent, for this purpose. Appropriate conditions for the reaction and detection of modified amino acids were developed using angiotensin II as a model peptide. We studied the modification of several model proteins with a known spatial arrangement (insulin, cytochrome c, lysozyme and human serum albumin). Our results revealed that the surface accessibility of residues is a necessary, although in itself insufficient, condition for their reactivity; the microenvironment of side-chains and the dynamics of proteinstructure also affect the ability of residues to react. However the detection of modified residues can be taken as proof of their surface accessibility, and of direct contact with solvent molecules.
Název v anglickém jazyce
Reactivity of histidine and lysine side-chains with diethylpyrocarbonate - A method to identify surface exposed residues in proteins
Popis výsledku anglicky
The chemical modification of amino acid side-chains followed by mass spectrometric detection can reveal at least partial information about the 3-D structure of proteins. In this work we tested diethylpyrocarbonate, as a common histidyl modification agent, for this purpose. Appropriate conditions for the reaction and detection of modified amino acids were developed using angiotensin II as a model peptide. We studied the modification of several model proteins with a known spatial arrangement (insulin, cytochrome c, lysozyme and human serum albumin). Our results revealed that the surface accessibility of residues is a necessary, although in itself insufficient, condition for their reactivity; the microenvironment of side-chains and the dynamics of proteinstructure also affect the ability of residues to react. However the detection of modified residues can be taken as proof of their surface accessibility, and of direct contact with solvent molecules.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2008
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Biochemical and Biophysical Methods
ISSN
0165-022X
e-ISSN
—
Svazek periodika
70
Číslo periodika v rámci svazku
6
Stát vydavatele periodika
NL - Nizozemsko
Počet stran výsledku
7
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000256393200043
EID výsledku v databázi Scopus
—