Free Energy Differences from Molecular Simulations: Exact Confidence Intervals from Transition Counts

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22330%2F23%3A43926083" target="_blank" >RIV/60461373:22330/23:43926083 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216208:11320/23:10472114

Výsledek na webu

<a href="https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.2c01237" target="_blank" >https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.2c01237</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.jctc.2c01237" target="_blank" >10.1021/acs.jctc.2c01237</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Free Energy Differences from Molecular Simulations: Exact Confidence Intervals from Transition Counts

Popis výsledku v původním jazyce

Here, we demonstrate a method to estimate the uncertainty (confidence intervals and standard errors) of free energy differences calculated by molecular simulations. The widths of confidence intervals and standard errors can be calculated solely from temperature and the number of transitions between states. Uncertainty (95% confidence interval) lower than ±1 kcal/mol can be achieved by a simulation with four forward and four reverse transitions. For a two-state Markovian system, the confidence interval is exact, regardless the number of transitions. © 2023 American Chemical Society

Název v anglickém jazyce

Free Energy Differences from Molecular Simulations: Exact Confidence Intervals from Transition Counts

Popis výsledku anglicky

Here, we demonstrate a method to estimate the uncertainty (confidence intervals and standard errors) of free energy differences calculated by molecular simulations. The widths of confidence intervals and standard errors can be calculated solely from temperature and the number of transitions between states. Uncertainty (95% confidence interval) lower than ±1 kcal/mol can be achieved by a simulation with four forward and four reverse transitions. For a two-state Markovian system, the confidence interval is exact, regardless the number of transitions. © 2023 American Chemical Society

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10403 - Physical chemistry

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2023

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal of Chemical Theory and Computation

ISSN

1549-9618

e-ISSN

1549-9626

Svazek periodika

19

Číslo periodika v rámci svazku

7

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

7

Strana od-do

2102-2108

Kód UT WoS článku

000970680700001

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85150412087