Comparison of intrinsic stacking energies of ten unique dinucleotide steps in A-RNA and B-DNA duplexes. Can we determine correct order of stability by quantum-chemical calculations?
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F10%3A00338172" target="_blank" >RIV/61388963:_____/10:00338172 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/68081707:_____/10:00338172
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Comparison of intrinsic stacking energies of ten unique dinucleotide steps in A-RNA and B-DNA duplexes. Can we determine correct order of stability by quantum-chemical calculations?
Popis výsledku v původním jazyce
High level ab initio methods have been used to study stacking interactions in ten unique base pair steps both in A-RNA and in B-DNA duplexes. The protocol for selection of geometries based on molecular dynamics (MD) simulations is proposed, and its suitability is demonstrated by comparison with stacking in steps at fiber diffraction geometries.
Název v anglickém jazyce
Comparison of intrinsic stacking energies of ten unique dinucleotide steps in A-RNA and B-DNA duplexes. Can we determine correct order of stability by quantum-chemical calculations?
Popis výsledku anglicky
High level ab initio methods have been used to study stacking interactions in ten unique base pair steps both in A-RNA and in B-DNA duplexes. The protocol for selection of geometries based on molecular dynamics (MD) simulations is proposed, and its suitability is demonstrated by comparison with stacking in steps at fiber diffraction geometries.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
BO - Biofyzika
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2010
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Physical Chemistry B
ISSN
1520-6106
e-ISSN
—
Svazek periodika
114
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
13
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000273405000061
EID výsledku v databázi Scopus
—