Chloroacetamide-Modified Nucleotide and RNA for Bioconjugations and Cross-Linking with RNA-Binding Proteins

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F23%3A00567559" target="_blank" >RIV/61388963:_____/23:00567559 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216208:11310/23:10474264

Výsledek na webu

<a href="https://doi.org/10.1002/anie.202213764" target="_blank" >https://doi.org/10.1002/anie.202213764</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1002/anie.202213764" target="_blank" >10.1002/anie.202213764</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Chloroacetamide-Modified Nucleotide and RNA for Bioconjugations and Cross-Linking with RNA-Binding Proteins

Popis výsledku v původním jazyce

Reactive RNA probes are useful for studying and identifying RNA-binding proteins. To that end, we designed and synthesized chloroacetamide-linked 7-deaza-ATP which was a good substrate for T7 RNA polymerase in in vitro transcription assay to synthesize reactive RNA probes bearing one or several reactive modifications. Modified RNA probes reacted with thiol-containing molecules as well as with cysteine- or histidine-containing peptides to form stable covalent products. They also reacted selectively with RNA-binding proteins to form cross-linked conjugates in high conversions thanks to proximity effect. Our modified nucleotide and RNA probes are promising tools for applications in RNA (bio)conjugations or RNA proteomics.

Název v anglickém jazyce

Chloroacetamide-Modified Nucleotide and RNA for Bioconjugations and Cross-Linking with RNA-Binding Proteins

Popis výsledku anglicky

Reactive RNA probes are useful for studying and identifying RNA-binding proteins. To that end, we designed and synthesized chloroacetamide-linked 7-deaza-ATP which was a good substrate for T7 RNA polymerase in in vitro transcription assay to synthesize reactive RNA probes bearing one or several reactive modifications. Modified RNA probes reacted with thiol-containing molecules as well as with cysteine- or histidine-containing peptides to form stable covalent products. They also reacted selectively with RNA-binding proteins to form cross-linked conjugates in high conversions thanks to proximity effect. Our modified nucleotide and RNA probes are promising tools for applications in RNA (bio)conjugations or RNA proteomics.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10401 - Organic chemistry

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2023

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Angewandte Chemie - International Edition

ISSN

1433-7851

e-ISSN

1521-3773

Svazek periodika

62

Číslo periodika v rámci svazku

7

Stát vydavatele periodika

DE - Spolková republika Německo

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

e202213764

Kód UT WoS článku

000911353300001

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85146093279