Expression, characterization and homology modeling of a novel eukaryotic GH84 beta-N-acetylglucosaminidase from Penicillium chrysogenum
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F14%3A00428345" target="_blank" >RIV/61388971:_____/14:00428345 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/67179843:_____/14:00428345
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.pep.2014.01.002" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.pep.2014.01.002</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.pep.2014.01.002" target="_blank" >10.1016/j.pep.2014.01.002</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Expression, characterization and homology modeling of a novel eukaryotic GH84 beta-N-acetylglucosaminidase from Penicillium chrysogenum
Popis výsledku v původním jazyce
Beta-N-acetylglucosaminidases from the family 84 of glycoside hydrolases form a small group of glycosidases in eukaryotes responsible for the modification of nuclear and cytosolic proteins with O-GlcNAc, thus they are involved in a number of important cell processes. Here, the first fungal beta-N-acetylglucosaminidase from Penicillium chrysogenum was expressed in Pichia pastoris and secreted into the media, purified and characterized. Moreover, homology modeling and substrate and inhibitor docking wereperformed to obtain structural information on this new member of the GH84 family. Surprisingly, we found that this fungal beta-N-acetylglucosaminidase with its sequence and structure perfectly fitting to the GH84 family displays biochemical properties rather resembling the beta-N-acetylhexosaminidases from the family 20 of glycoside hydrolases. This work helped to increase the knowledge on the scarcely studied glycosidase family and revealed a new type of eukaryotic beta-N-acetylglucosam
Název v anglickém jazyce
Expression, characterization and homology modeling of a novel eukaryotic GH84 beta-N-acetylglucosaminidase from Penicillium chrysogenum
Popis výsledku anglicky
Beta-N-acetylglucosaminidases from the family 84 of glycoside hydrolases form a small group of glycosidases in eukaryotes responsible for the modification of nuclear and cytosolic proteins with O-GlcNAc, thus they are involved in a number of important cell processes. Here, the first fungal beta-N-acetylglucosaminidase from Penicillium chrysogenum was expressed in Pichia pastoris and secreted into the media, purified and characterized. Moreover, homology modeling and substrate and inhibitor docking wereperformed to obtain structural information on this new member of the GH84 family. Surprisingly, we found that this fungal beta-N-acetylglucosaminidase with its sequence and structure perfectly fitting to the GH84 family displays biochemical properties rather resembling the beta-N-acetylhexosaminidases from the family 20 of glycoside hydrolases. This work helped to increase the knowledge on the scarcely studied glycosidase family and revealed a new type of eukaryotic beta-N-acetylglucosam
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Protein Expression and Purification
ISSN
1046-5928
e-ISSN
—
Svazek periodika
95
Číslo periodika v rámci svazku
MAR 2014
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
7
Strana od-do
204-210
Kód UT WoS článku
000332192900029
EID výsledku v databázi Scopus
—