Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Exploration of GH94 Sequence Space for Enzyme Discovery Reveals a Novel Glucosylgalactose Phosphorylase Specificity

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F21%3A00549584" target="_blank" >RIV/61388971:_____/21:00549584 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://chemistry-europe.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/cbic.202100401" target="_blank" >https://chemistry-europe.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/cbic.202100401</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1002/cbic.202100401" target="_blank" >10.1002/cbic.202100401</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Exploration of GH94 Sequence Space for Enzyme Discovery Reveals a Novel Glucosylgalactose Phosphorylase Specificity

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The substantial increase in DNA sequencing efforts has led to a rapid expansion of available sequences in glycoside hydrolase families. The ever-increasing sequence space presents considerable opportunities for the search for enzymes with novel functionalities. In this work, the sequence-function space of glycoside hydrolase family 94 (GH94) was explored in detail, using a combined approach of phylogenetic analysis and sequence similarity networks. The identification and experimental screening of unknown clusters led to the discovery of an enzyme from the soil bacterium Paenibacillus polymyxa that acts as a 4-O-beta-d-glucosyl-d-galactose phosphorylase (GGalP), a specificity that has not been reported to date. Detailed characterization of GGalP revealed that its kinetic parameters were consistent with those of other known phosphorylases. Furthermore, the enzyme could be used for production of the rare disaccharides 4-O-beta-d-glucosyl-d-galactose and 4-O-beta-d-glucosyl-l-arabinose. Our current work highlights the power of rational sequence space exploration in the search for novel enzyme specificities, as well as the potential of phosphorylases for rare disaccharide synthesis.

  • Název v anglickém jazyce

    Exploration of GH94 Sequence Space for Enzyme Discovery Reveals a Novel Glucosylgalactose Phosphorylase Specificity

  • Popis výsledku anglicky

    The substantial increase in DNA sequencing efforts has led to a rapid expansion of available sequences in glycoside hydrolase families. The ever-increasing sequence space presents considerable opportunities for the search for enzymes with novel functionalities. In this work, the sequence-function space of glycoside hydrolase family 94 (GH94) was explored in detail, using a combined approach of phylogenetic analysis and sequence similarity networks. The identification and experimental screening of unknown clusters led to the discovery of an enzyme from the soil bacterium Paenibacillus polymyxa that acts as a 4-O-beta-d-glucosyl-d-galactose phosphorylase (GGalP), a specificity that has not been reported to date. Detailed characterization of GGalP revealed that its kinetic parameters were consistent with those of other known phosphorylases. Furthermore, the enzyme could be used for production of the rare disaccharides 4-O-beta-d-glucosyl-d-galactose and 4-O-beta-d-glucosyl-l-arabinose. Our current work highlights the power of rational sequence space exploration in the search for novel enzyme specificities, as well as the potential of phosphorylases for rare disaccharide synthesis.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Chembiochem

  • ISSN

    1439-4227

  • e-ISSN

    1439-7633

  • Svazek periodika

    22

  • Číslo periodika v rámci svazku

    23

  • Stát vydavatele periodika

    DE - Spolková republika Německo

  • Počet stran výsledku

    7

  • Strana od-do

    3319-3325

  • Kód UT WoS článku

    000704237900001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85116443660