Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Sigma regulatory network in Rhodococcus erythropolis CCM2595

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F22%3A00555955" target="_blank" >RIV/61388971:_____/22:00555955 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216208:11310/22:10442590

  • Výsledek na webu

    <a href="https://academic.oup.com/femsle/article-abstract/369/1/fnac014/6528914?redirectedFrom=fulltext#no-access-message" target="_blank" >https://academic.oup.com/femsle/article-abstract/369/1/fnac014/6528914?redirectedFrom=fulltext#no-access-message</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1093/femsle/fnac014" target="_blank" >10.1093/femsle/fnac014</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Sigma regulatory network in Rhodococcus erythropolis CCM2595

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The aim of this investigation was to discover the promoters that drive expression of the sig genes encoding sigma factors of RNA polymerase in Rhodococcus erythropolis CCM2595 and classify these promoters according to the sigma factors which control their activity. To analyze the regulation of major sigma factors, which control large regulons that also contain genes expressed under exponential growth and non-stressed conditions, we used the R. erythropolis CCM2595 culture, which grew rapidly in minimal medium. The transcriptional start sites (TSSs) of the genes sigA, sigB, sigD, sigE, sigG, sigH, sigJ, and sigK were detected by primary 5 '-end-specific RNA sequencing. The promoters localized upstream of the detected TSSs were defined by their35 and10 elements, which were identical or closely similar to these sequences in the related species Corynebacterium glutamicum and Mycobacterium tuberculosis. Regulation of the promoter activities by different sigma factors was demonstrated by two independent techniques (in vivo and in vitro). All analyzed sig genes encoding the sigma factors with extracytoplasmic function (ECF) were found to be also driven from additional housekeeping promoters. Based on the classification of the sig gene promoters, a model of the basic sigma transcriptional regulatory network in R. erythropolis was designed.

  • Název v anglickém jazyce

    Sigma regulatory network in Rhodococcus erythropolis CCM2595

  • Popis výsledku anglicky

    The aim of this investigation was to discover the promoters that drive expression of the sig genes encoding sigma factors of RNA polymerase in Rhodococcus erythropolis CCM2595 and classify these promoters according to the sigma factors which control their activity. To analyze the regulation of major sigma factors, which control large regulons that also contain genes expressed under exponential growth and non-stressed conditions, we used the R. erythropolis CCM2595 culture, which grew rapidly in minimal medium. The transcriptional start sites (TSSs) of the genes sigA, sigB, sigD, sigE, sigG, sigH, sigJ, and sigK were detected by primary 5 '-end-specific RNA sequencing. The promoters localized upstream of the detected TSSs were defined by their35 and10 elements, which were identical or closely similar to these sequences in the related species Corynebacterium glutamicum and Mycobacterium tuberculosis. Regulation of the promoter activities by different sigma factors was demonstrated by two independent techniques (in vivo and in vitro). All analyzed sig genes encoding the sigma factors with extracytoplasmic function (ECF) were found to be also driven from additional housekeeping promoters. Based on the classification of the sig gene promoters, a model of the basic sigma transcriptional regulatory network in R. erythropolis was designed.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10606 - Microbiology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA18-13254S" target="_blank" >GA18-13254S: Stresové odpovědi bakteriálního degradéra toxických polutantů Rhodococcus erythropolis</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2022

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    FEMS Microbiology Letters

  • ISSN

    0378-1097

  • e-ISSN

    1574-6968

  • Svazek periodika

    369

  • Číslo periodika v rámci svazku

    1

  • Stát vydavatele periodika

    NL - Nizozemsko

  • Počet stran výsledku

    10

  • Strana od-do

    fnac014

  • Kód UT WoS článku

    000764887700002

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85125019957