Top-Down Proteoform Analysis by 2D MS with Quadrupolar Detection
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F23%3A00579428" target="_blank" >RIV/61388971:_____/23:00579428 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00216208:11310/23:10471480
Výsledek na webu
<a href="https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.3c02225" target="_blank" >https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.3c02225</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.analchem.3c02225" target="_blank" >10.1021/acs.analchem.3c02225</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Top-Down Proteoform Analysis by 2D MS with Quadrupolar Detection
Popis výsledku v původním jazyce
Two-dimensional mass spectrometry (2D MS) is a multiplexed tandem mass spectrometry method that does not rely on ion isolation to correlate the precursor and fragment ions. On a Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometer (FT-ICR MS), 2D MS instead uses the modulation of precursor ion radii inside the ICR cell before fragmentation and yields 2D mass spectra that show the fragmentation patterns of all the analytes. In this study, we perform 2D MS for the first time with quadrupolar detection in a dynamically harmonized ICR cell. We discuss the advantages of quadrupolar detection in 2D MS and how we adapted existing data processing techniques for accurate frequency-to-mass conversion. We apply 2D MS with quadrupolar detection to the top-down analysis of covalently labeled ubiquitin with ECD fragmentation, and we develop a workflow for label-free relative quantification of biomolecule isoforms in 2D MS.
Název v anglickém jazyce
Top-Down Proteoform Analysis by 2D MS with Quadrupolar Detection
Popis výsledku anglicky
Two-dimensional mass spectrometry (2D MS) is a multiplexed tandem mass spectrometry method that does not rely on ion isolation to correlate the precursor and fragment ions. On a Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometer (FT-ICR MS), 2D MS instead uses the modulation of precursor ion radii inside the ICR cell before fragmentation and yields 2D mass spectra that show the fragmentation patterns of all the analytes. In this study, we perform 2D MS for the first time with quadrupolar detection in a dynamically harmonized ICR cell. We discuss the advantages of quadrupolar detection in 2D MS and how we adapted existing data processing techniques for accurate frequency-to-mass conversion. We apply 2D MS with quadrupolar detection to the top-down analysis of covalently labeled ubiquitin with ECD fragmentation, and we develop a workflow for label-free relative quantification of biomolecule isoforms in 2D MS.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10406 - Analytical chemistry
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2023
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Analytical Chemistry
ISSN
0003-2700
e-ISSN
1520-6882
Svazek periodika
95
Číslo periodika v rámci svazku
44
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
8
Strana od-do
16123-16130
Kód UT WoS článku
001101047900001
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85178259308