Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Immunocytochemical Visualization of Proteins from Cyanobacterial Cells with High Autofluorescence of Phycoerythrin and Phycourobilin

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F23%3A00582456" target="_blank" >RIV/61388971:_____/23:00582456 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.jove.com/t/65168/immunocytochemical-visualization-proteins-from-cyanobacterial-cells" target="_blank" >https://www.jove.com/t/65168/immunocytochemical-visualization-proteins-from-cyanobacterial-cells</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3791/65168" target="_blank" >10.3791/65168</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Immunocytochemical Visualization of Proteins from Cyanobacterial Cells with High Autofluorescence of Phycoerythrin and Phycourobilin

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Presented is a protocol for visualizing and quantifying a specific protein in cells at the cellular level for the marine cyanobacterium Crocosphaera watsonii, a crucial primary producer and nitrogen fixer in oligotrophic oceans. One of the challenges for marine autotrophic N2 fixers (diazotrophs) is distinguishing probe-derived fluorescence signals from autofluorescence. C. watsonii was selected to represent chlorophyll-, phycoerythrin-and phycourobilin-containing cyanobacteria. The protocol allows for simple and semi-quantitative visualization of proteins in C. watsonii at a single-cell level, enabling investigation of protein production under different environmental conditions to evaluate the metabolic activities of the target cyanobacteria. Furthermore, the fixation and permeabilization methods are optimized to enhance the fluorescence signals from target proteins to distinguish them from autofluorescence, especially from phycoerythrin and phycourobilin. The enhanced signal can be visualized using confocal or widefield fluorescence microscopy. Additionally, fluorescence intensity was semi-quantified using Fiji software. This single-cell analysis workflow allows the evaluation of cell-to-cell variations of specific protein content. The protocol can be performed in any life science laboratory as it requires only standard equipment and can also be easily adapted to other phycoerythrin-containing cyanobacterial cells. © 2023 JoVE Journal of Visualized Experiments.

  • Název v anglickém jazyce

    Immunocytochemical Visualization of Proteins from Cyanobacterial Cells with High Autofluorescence of Phycoerythrin and Phycourobilin

  • Popis výsledku anglicky

    Presented is a protocol for visualizing and quantifying a specific protein in cells at the cellular level for the marine cyanobacterium Crocosphaera watsonii, a crucial primary producer and nitrogen fixer in oligotrophic oceans. One of the challenges for marine autotrophic N2 fixers (diazotrophs) is distinguishing probe-derived fluorescence signals from autofluorescence. C. watsonii was selected to represent chlorophyll-, phycoerythrin-and phycourobilin-containing cyanobacteria. The protocol allows for simple and semi-quantitative visualization of proteins in C. watsonii at a single-cell level, enabling investigation of protein production under different environmental conditions to evaluate the metabolic activities of the target cyanobacteria. Furthermore, the fixation and permeabilization methods are optimized to enhance the fluorescence signals from target proteins to distinguish them from autofluorescence, especially from phycoerythrin and phycourobilin. The enhanced signal can be visualized using confocal or widefield fluorescence microscopy. Additionally, fluorescence intensity was semi-quantified using Fiji software. This single-cell analysis workflow allows the evaluation of cell-to-cell variations of specific protein content. The protocol can be performed in any life science laboratory as it requires only standard equipment and can also be easily adapted to other phycoerythrin-containing cyanobacterial cells. © 2023 JoVE Journal of Visualized Experiments.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10606 - Microbiology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA20-17627S" target="_blank" >GA20-17627S: Metabolismy C a N u jednobuněčných diazotrofních sinic a důsledky pro jejich ekologický význam</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2023

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Jove-Journal of Visualized Experiments

  • ISSN

    1940-087X

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    2023

  • Číslo periodika v rámci svazku

    199

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    16

  • Strana od-do

    e65168

  • Kód UT WoS článku

    001159858200019

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85172771682