Next-Generation Survey Sequencing and the Molecular Organization of Wheat Chromosome 6B
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F14%3A00432722" target="_blank" >RIV/61389030:_____/14:00432722 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/dnares/dst041" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1093/dnares/dst041</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/dnares/dst041" target="_blank" >10.1093/dnares/dst041</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Next-Generation Survey Sequencing and the Molecular Organization of Wheat Chromosome 6B
Popis výsledku v původním jazyce
Common wheat (Triticum aestivum L.) is one of the most important cereals in the world. To improve wheat quality and productivity, the genomic sequence of wheat must be determined. The large genome size (similar to 17 Gb/1 C) and the hexaploid status of wheat have hampered the genome sequencing of wheat. However, flow sorting of individual chromosomes has allowed us to purify and separately shotgun-sequence a pair of telocentric chromosomes. Here, we describe a result from the survey sequencing of wheatchromosome 6B (914 Mb/1 C) using massively parallel 454 pyrosequencing. From the 4.94 and 5.51 Gb shotgun sequence data from the two chromosome arms of 6BS and 6BL, 235 and 273 Mb sequences were assembled to cover similar to 55.6 and 54.9% of the total genomic regions, respectively. Repetitive sequences composed 77 and 86% of the assembled sequences on 6BS and 6BL, respectively. Within the assembled sequences, we predicted a total of 4798 non-repetitive gene loci with the evidence of exp
Název v anglickém jazyce
Next-Generation Survey Sequencing and the Molecular Organization of Wheat Chromosome 6B
Popis výsledku anglicky
Common wheat (Triticum aestivum L.) is one of the most important cereals in the world. To improve wheat quality and productivity, the genomic sequence of wheat must be determined. The large genome size (similar to 17 Gb/1 C) and the hexaploid status of wheat have hampered the genome sequencing of wheat. However, flow sorting of individual chromosomes has allowed us to purify and separately shotgun-sequence a pair of telocentric chromosomes. Here, we describe a result from the survey sequencing of wheatchromosome 6B (914 Mb/1 C) using massively parallel 454 pyrosequencing. From the 4.94 and 5.51 Gb shotgun sequence data from the two chromosome arms of 6BS and 6BL, 235 and 273 Mb sequences were assembled to cover similar to 55.6 and 54.9% of the total genomic regions, respectively. Repetitive sequences composed 77 and 86% of the assembled sequences on 6BS and 6BL, respectively. Within the assembled sequences, we predicted a total of 4798 non-repetitive gene loci with the evidence of exp
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GBP501%2F12%2FG090" target="_blank" >GBP501/12/G090: Evoluce a funkce komplexních genomů rostlin</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Dna Research
ISSN
1340-2838
e-ISSN
—
Svazek periodika
21
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
12
Strana od-do
103-114
Kód UT WoS článku
000339897500001
EID výsledku v databázi Scopus
—