Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Next-Generation Survey Sequencing and the Molecular Organization of Wheat Chromosome 6B

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F14%3A00432722" target="_blank" >RIV/61389030:_____/14:00432722 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1093/dnares/dst041" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1093/dnares/dst041</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1093/dnares/dst041" target="_blank" >10.1093/dnares/dst041</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Next-Generation Survey Sequencing and the Molecular Organization of Wheat Chromosome 6B

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Common wheat (Triticum aestivum L.) is one of the most important cereals in the world. To improve wheat quality and productivity, the genomic sequence of wheat must be determined. The large genome size (similar to 17 Gb/1 C) and the hexaploid status of wheat have hampered the genome sequencing of wheat. However, flow sorting of individual chromosomes has allowed us to purify and separately shotgun-sequence a pair of telocentric chromosomes. Here, we describe a result from the survey sequencing of wheatchromosome 6B (914 Mb/1 C) using massively parallel 454 pyrosequencing. From the 4.94 and 5.51 Gb shotgun sequence data from the two chromosome arms of 6BS and 6BL, 235 and 273 Mb sequences were assembled to cover similar to 55.6 and 54.9% of the total genomic regions, respectively. Repetitive sequences composed 77 and 86% of the assembled sequences on 6BS and 6BL, respectively. Within the assembled sequences, we predicted a total of 4798 non-repetitive gene loci with the evidence of exp

  • Název v anglickém jazyce

    Next-Generation Survey Sequencing and the Molecular Organization of Wheat Chromosome 6B

  • Popis výsledku anglicky

    Common wheat (Triticum aestivum L.) is one of the most important cereals in the world. To improve wheat quality and productivity, the genomic sequence of wheat must be determined. The large genome size (similar to 17 Gb/1 C) and the hexaploid status of wheat have hampered the genome sequencing of wheat. However, flow sorting of individual chromosomes has allowed us to purify and separately shotgun-sequence a pair of telocentric chromosomes. Here, we describe a result from the survey sequencing of wheatchromosome 6B (914 Mb/1 C) using massively parallel 454 pyrosequencing. From the 4.94 and 5.51 Gb shotgun sequence data from the two chromosome arms of 6BS and 6BL, 235 and 273 Mb sequences were assembled to cover similar to 55.6 and 54.9% of the total genomic regions, respectively. Repetitive sequences composed 77 and 86% of the assembled sequences on 6BS and 6BL, respectively. Within the assembled sequences, we predicted a total of 4798 non-repetitive gene loci with the evidence of exp

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GBP501%2F12%2FG090" target="_blank" >GBP501/12/G090: Evoluce a funkce komplexních genomů rostlin</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2014

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Dna Research

  • ISSN

    1340-2838

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    21

  • Číslo periodika v rámci svazku

    2

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    12

  • Strana od-do

    103-114

  • Kód UT WoS článku

    000339897500001

  • EID výsledku v databázi Scopus