Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Multiple displacement amplification of the DNA from single flow?sorted plant chromosome

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F15%3A00454969" target="_blank" >RIV/61389030:_____/15:00454969 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1111/tpj.13035" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1111/tpj.13035</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1111/tpj.13035" target="_blank" >10.1111/tpj.13035</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Multiple displacement amplification of the DNA from single flow?sorted plant chromosome

  • Popis výsledku v původním jazyce

    A protocol is described for production of micrograms of DNA from single copies of flow-sorted plant chromosomes. Of 183 single copies of wheat chromosome 3B, 118 (64%) were successfully amplified. Sequencing DNA amplification products using an Illumina HiSeq 2000 system to 10 coverage and merging sequences from three separate amplifications resulted in 60% coverage of the chromosome 3B reference, entirely covering 30% of its genes. The merged sequences permitted de novo assembly of 19% of chromosome 3Bgenes, with 10% of genes contained in a single contig, and 39% of genes covered for at least 80% of their length. The chromosome-derived sequences allowed identification of missing genic sequences in the chromosome 3B reference and short sequences similar to 3B in survey sequences of other wheat chromosomes. These observations indicate that single-chromosome sequencing is suitable to identify genic sequences on particular chromosomes, to develop chromosome-specific DNA markers, to verify

  • Název v anglickém jazyce

    Multiple displacement amplification of the DNA from single flow?sorted plant chromosome

  • Popis výsledku anglicky

    A protocol is described for production of micrograms of DNA from single copies of flow-sorted plant chromosomes. Of 183 single copies of wheat chromosome 3B, 118 (64%) were successfully amplified. Sequencing DNA amplification products using an Illumina HiSeq 2000 system to 10 coverage and merging sequences from three separate amplifications resulted in 60% coverage of the chromosome 3B reference, entirely covering 30% of its genes. The merged sequences permitted de novo assembly of 19% of chromosome 3Bgenes, with 10% of genes contained in a single contig, and 39% of genes covered for at least 80% of their length. The chromosome-derived sequences allowed identification of missing genic sequences in the chromosome 3B reference and short sequences similar to 3B in survey sequences of other wheat chromosomes. These observations indicate that single-chromosome sequencing is suitable to identify genic sequences on particular chromosomes, to develop chromosome-specific DNA markers, to verify

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2015

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Plant Journal

  • ISSN

    0960-7412

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    84

  • Číslo periodika v rámci svazku

    4

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    7

  • Strana od-do

    838-844

  • Kód UT WoS článku

    000368259100016

  • EID výsledku v databázi Scopus