Transcriptome of barley under three different heavy metal stress reaction
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F17%3A00482959" target="_blank" >RIV/61389030:_____/17:00482959 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/68081707:_____/17:00507078
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.gdata.2017.05.016" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.gdata.2017.05.016</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.gdata.2017.05.016" target="_blank" >10.1016/j.gdata.2017.05.016</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Transcriptome of barley under three different heavy metal stress reaction
Popis výsledku v původním jazyce
In the present study, we used Illumina sequencing technology (HiSeq 2000) to sequence the transcriptome of barley (Hordeum vulgare L., cv. Morex) under three different heavy metal stress conditions: copper, zinc and cadmium. For each of those metals, the concentration causing a 50% inhibitory effect for root growth (EC50) was determined. We sequenced the total RNA of both roots and shoots from barley with and without heavy metal treatments in three replicates. Raw reads of the transcriptome project have been deposited in NCBI's BioProject accession number PRJNA382490. The obtained transcriptomic data will be useful for further studies focusing on heavy metal tolerance and comparative transcriptome analysis in barley.
Název v anglickém jazyce
Transcriptome of barley under three different heavy metal stress reaction
Popis výsledku anglicky
In the present study, we used Illumina sequencing technology (HiSeq 2000) to sequence the transcriptome of barley (Hordeum vulgare L., cv. Morex) under three different heavy metal stress conditions: copper, zinc and cadmium. For each of those metals, the concentration causing a 50% inhibitory effect for root growth (EC50) was determined. We sequenced the total RNA of both roots and shoots from barley with and without heavy metal treatments in three replicates. Raw reads of the transcriptome project have been deposited in NCBI's BioProject accession number PRJNA382490. The obtained transcriptomic data will be useful for further studies focusing on heavy metal tolerance and comparative transcriptome analysis in barley.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10611 - Plant sciences, botany
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GBP501%2F12%2FG090" target="_blank" >GBP501/12/G090: Evoluce a funkce komplexních genomů rostlin</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2017
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
GENOMICS DATA
ISSN
2213-5960
e-ISSN
—
Svazek periodika
13
Číslo periodika v rámci svazku
SEP
Stát vydavatele periodika
NL - Nizozemsko
Počet stran výsledku
3
Strana od-do
15-17
Kód UT WoS článku
000415937000006
EID výsledku v databázi Scopus
—