Utilization of high-accuracy FTICR-MS data in protein quantitation experiments

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F09%3A00010450" target="_blank" >RIV/61989592:15310/09:00010450 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/61388971:_____/09:00338590 RIV/61989592:15110/09:00009505

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Utilization of high-accuracy FTICR-MS data in protein quantitation experiments

Popis výsledku v původním jazyce

Human acute T-lymphoblastic leukemia cell line (CEM) treated with cisplatin, and the stable isotope labeling by amino acids in cell culture (SILAC) strategy were used to present an improved method of data processing in high-accuracy mass spectrometry (MS). By using peptide mass fingerprinting with low mass tolerance, we were able to utilize far more data retained in MS scans which would normally be missed by a standard processing method. This new way of data interpretation results in an improvement of the relevance of quantitation experiments and enabled us to search and quantify different types of posttranslational modifications. Furthermore, we used this technique to distinguish among different protein isoforms, commonly returned by Mascot search engine.

Název v anglickém jazyce

Utilization of high-accuracy FTICR-MS data in protein quantitation experiments

Popis výsledku anglicky

Human acute T-lymphoblastic leukemia cell line (CEM) treated with cisplatin, and the stable isotope labeling by amino acids in cell culture (SILAC) strategy were used to present an improved method of data processing in high-accuracy mass spectrometry (MS). By using peptide mass fingerprinting with low mass tolerance, we were able to utilize far more data retained in MS scans which would normally be missed by a standard processing method. This new way of data interpretation results in an improvement of the relevance of quantitation experiments and enabled us to search and quantify different types of posttranslational modifications. Furthermore, we used this technique to distinguish among different protein isoforms, commonly returned by Mascot search engine.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CB - Analytická chemie, separace

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/LC07017" target="_blank" >LC07017: Centrum nádorové proteomiky</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2009

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal of Mass Spectrometry

ISSN

1076-5174

e-ISSN

—

Svazek periodika

44

Číslo periodika v rámci svazku

11

Stát vydavatele periodika

DE - Spolková republika Německo

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

—

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—