Binding of Quinidine Radically Increases the Stability and Decreases the Flexibility of the Cytochrome P450 2D6 Active Site
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F12%3A33141136" target="_blank" >RIV/61989592:15310/12:33141136 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61989592:15110/12:33141136
Výsledek na webu
<a href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0162013412000542" target="_blank" >http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0162013412000542</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.jinorgbio.2012.02.010" target="_blank" >10.1016/j.jinorgbio.2012.02.010</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Binding of Quinidine Radically Increases the Stability and Decreases the Flexibility of the Cytochrome P450 2D6 Active Site
Popis výsledku v původním jazyce
Human cytochrome P450 2D6 (CYP2D6) is an enzyme of the CYP superfamily responsible for biotransformation of about 20% of drugs of known metabolism containing a basic nitrogen and a planar aromatic ring. Here, we present a combined experimental and computational study on the compressibility and ?exibility of unliganded and quinidine-bound CYP2D6. Experimentally, high-pressure induced Soret band shifts of the enzyme were measured by UV/VIS spectroscopy, while 100 ns all atomic molecular dynamics (MD) simulations in explicit water were used in the computational analysis. We identi?ed sharp differences between ligand-free and quinidine-bound CYP2D6 forms in compressibility, ?exibility parameters and active site solvation. While the unliganded CYP2D6 is compressible, quinidine binding signi?cantly rigidi?es the CYP2D6 active site. In addition, MD simulations show that quinidine binding results in pronounced reductions in active site ?exibility and solvation.
Název v anglickém jazyce
Binding of Quinidine Radically Increases the Stability and Decreases the Flexibility of the Cytochrome P450 2D6 Active Site
Popis výsledku anglicky
Human cytochrome P450 2D6 (CYP2D6) is an enzyme of the CYP superfamily responsible for biotransformation of about 20% of drugs of known metabolism containing a basic nitrogen and a planar aromatic ring. Here, we present a combined experimental and computational study on the compressibility and ?exibility of unliganded and quinidine-bound CYP2D6. Experimentally, high-pressure induced Soret band shifts of the enzyme were measured by UV/VIS spectroscopy, while 100 ns all atomic molecular dynamics (MD) simulations in explicit water were used in the computational analysis. We identi?ed sharp differences between ligand-free and quinidine-bound CYP2D6 forms in compressibility, ?exibility parameters and active site solvation. While the unliganded CYP2D6 is compressible, quinidine binding signi?cantly rigidi?es the CYP2D6 active site. In addition, MD simulations show that quinidine binding results in pronounced reductions in active site ?exibility and solvation.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
FR - Farmakologie a lékárnická chemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2012
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Inorganic Biochemistry
ISSN
0162-0134
e-ISSN
—
Svazek periodika
110
Číslo periodika v rámci svazku
MAY
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
5
Strana od-do
46-50
Kód UT WoS článku
000304335700008
EID výsledku v databázi Scopus
—