Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Binding of Quinidine Radically Increases the Stability and Decreases the Flexibility of the Cytochrome P450 2D6 Active Site

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F12%3A33141136" target="_blank" >RIV/61989592:15310/12:33141136 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/61989592:15110/12:33141136

  • Výsledek na webu

    <a href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0162013412000542" target="_blank" >http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0162013412000542</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.jinorgbio.2012.02.010" target="_blank" >10.1016/j.jinorgbio.2012.02.010</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Binding of Quinidine Radically Increases the Stability and Decreases the Flexibility of the Cytochrome P450 2D6 Active Site

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Human cytochrome P450 2D6 (CYP2D6) is an enzyme of the CYP superfamily responsible for biotransformation of about 20% of drugs of known metabolism containing a basic nitrogen and a planar aromatic ring. Here, we present a combined experimental and computational study on the compressibility and ?exibility of unliganded and quinidine-bound CYP2D6. Experimentally, high-pressure induced Soret band shifts of the enzyme were measured by UV/VIS spectroscopy, while 100 ns all atomic molecular dynamics (MD) simulations in explicit water were used in the computational analysis. We identi?ed sharp differences between ligand-free and quinidine-bound CYP2D6 forms in compressibility, ?exibility parameters and active site solvation. While the unliganded CYP2D6 is compressible, quinidine binding signi?cantly rigidi?es the CYP2D6 active site. In addition, MD simulations show that quinidine binding results in pronounced reductions in active site ?exibility and solvation.

  • Název v anglickém jazyce

    Binding of Quinidine Radically Increases the Stability and Decreases the Flexibility of the Cytochrome P450 2D6 Active Site

  • Popis výsledku anglicky

    Human cytochrome P450 2D6 (CYP2D6) is an enzyme of the CYP superfamily responsible for biotransformation of about 20% of drugs of known metabolism containing a basic nitrogen and a planar aromatic ring. Here, we present a combined experimental and computational study on the compressibility and ?exibility of unliganded and quinidine-bound CYP2D6. Experimentally, high-pressure induced Soret band shifts of the enzyme were measured by UV/VIS spectroscopy, while 100 ns all atomic molecular dynamics (MD) simulations in explicit water were used in the computational analysis. We identi?ed sharp differences between ligand-free and quinidine-bound CYP2D6 forms in compressibility, ?exibility parameters and active site solvation. While the unliganded CYP2D6 is compressible, quinidine binding signi?cantly rigidi?es the CYP2D6 active site. In addition, MD simulations show that quinidine binding results in pronounced reductions in active site ?exibility and solvation.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    FR - Farmakologie a lékárnická chemie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2012

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Journal of Inorganic Biochemistry

  • ISSN

    0162-0134

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    110

  • Číslo periodika v rámci svazku

    MAY

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    5

  • Strana od-do

    46-50

  • Kód UT WoS článku

    000304335700008

  • EID výsledku v databázi Scopus