Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Marine Oomycetes of the Genus Halophytophthora Harbor Viruses Related to Bunyaviruses

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43410%2F20%3A43918186" target="_blank" >RIV/62156489:43410/20:43918186 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.01467" target="_blank" >https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.01467</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2020.01467" target="_blank" >10.3389/fmicb.2020.01467</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Marine Oomycetes of the Genus Halophytophthora Harbor Viruses Related to Bunyaviruses

  • Popis výsledku v původním jazyce

    We investigated the incidence of RNA viruses in a collection of Halophytophthora spp. from estuarine ecosystems in southern Portugal. The first approach to detect the presence of viruses was based on the occurrence of dsRNA, typically considered as a viral molecule in plants and fungi. Two dsRNA-banding patterns (TILDE OPERATOR+D917 and 9 kb) were observed in seven of 73 Halophytophthora isolates tested (9.6%). Consequently, two dsRNA-hosting isolates were chosen to perform stranded RNA sequencing for de novo virus sequence assembly. A total of eight putative novel virus species with genomic affinities to members of the order Bunyavirales were detected and their full-length RdRp gene characterized by RACE. Based on the direct partial amplification of their RdRp gene by RT-PCR multiple viral infections occur in both isolates selected. Likewise, the screening of those viruses in the whole collection of Halophytophthora isolates showed that their occurrence is limited to one single Halophytophthora species. To our knowledge, this is the first report demonstrating the presence of negative (MINUS SIGN ) ssRNA viruses in marine oomycetes.

  • Název v anglickém jazyce

    Marine Oomycetes of the Genus Halophytophthora Harbor Viruses Related to Bunyaviruses

  • Popis výsledku anglicky

    We investigated the incidence of RNA viruses in a collection of Halophytophthora spp. from estuarine ecosystems in southern Portugal. The first approach to detect the presence of viruses was based on the occurrence of dsRNA, typically considered as a viral molecule in plants and fungi. Two dsRNA-banding patterns (TILDE OPERATOR+D917 and 9 kb) were observed in seven of 73 Halophytophthora isolates tested (9.6%). Consequently, two dsRNA-hosting isolates were chosen to perform stranded RNA sequencing for de novo virus sequence assembly. A total of eight putative novel virus species with genomic affinities to members of the order Bunyavirales were detected and their full-length RdRp gene characterized by RACE. Based on the direct partial amplification of their RdRp gene by RT-PCR multiple viral infections occur in both isolates selected. Likewise, the screening of those viruses in the whole collection of Halophytophthora isolates showed that their occurrence is limited to one single Halophytophthora species. To our knowledge, this is the first report demonstrating the presence of negative (MINUS SIGN ) ssRNA viruses in marine oomycetes.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10606 - Microbiology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/EF15_003%2F0000453" target="_blank" >EF15_003/0000453: Výzkumné centrum pro studium patogenů z rodu Phytophthora</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Frontiers in Microbiology

  • ISSN

    1664-302X

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    11

  • Číslo periodika v rámci svazku

    15 July

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    13

  • Strana od-do

    1467

  • Kód UT WoS článku

    000556883300001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85088795863