A novel mitovirus detected in Diaporthe rudis, a fungus associated with Phomopsis dieback on grapevines
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43410%2F20%3A43918223" target="_blank" >RIV/62156489:43410/20:43918223 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/62156489:43510/20:43918223
Výsledek na webu
<a href="https://doi.org/10.1007/s00705-020-04755-8" target="_blank" >https://doi.org/10.1007/s00705-020-04755-8</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00705-020-04755-8" target="_blank" >10.1007/s00705-020-04755-8</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
A novel mitovirus detected in Diaporthe rudis, a fungus associated with Phomopsis dieback on grapevines
Popis výsledku v původním jazyce
The genome sequence of a mitovirus found in an isolate of Diaporthe rudis, one of the causal agents of Phomopsis dieback on grapevines, was determined by two high-throughput sequencing approaches, small RNA and total RNA sequencing. The genome of this mitovirus is 2,455 nt in length and includes a single large open reading frame (ORF) encoding an RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). A BLASTx comparison of the full-length genome sequence showed the highest similarity (54.15%) with that of Colletotrichum falcatum mitovirus 1 (CfMV1). Our results reveal a new member of the genus Mitovirus first detected in D. rudis (Fr.) Nitschke, with the proposed name "Diaporthe rudis mitovirus 1" (DrMV1).
Název v anglickém jazyce
A novel mitovirus detected in Diaporthe rudis, a fungus associated with Phomopsis dieback on grapevines
Popis výsledku anglicky
The genome sequence of a mitovirus found in an isolate of Diaporthe rudis, one of the causal agents of Phomopsis dieback on grapevines, was determined by two high-throughput sequencing approaches, small RNA and total RNA sequencing. The genome of this mitovirus is 2,455 nt in length and includes a single large open reading frame (ORF) encoding an RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). A BLASTx comparison of the full-length genome sequence showed the highest similarity (54.15%) with that of Colletotrichum falcatum mitovirus 1 (CfMV1). Our results reveal a new member of the genus Mitovirus first detected in D. rudis (Fr.) Nitschke, with the proposed name "Diaporthe rudis mitovirus 1" (DrMV1).
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
40105 - Horticulture, viticulture
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/EF15_003%2F0000453" target="_blank" >EF15_003/0000453: Výzkumné centrum pro studium patogenů z rodu Phytophthora</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2020
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Archives of Virology
ISSN
0304-8608
e-ISSN
—
Svazek periodika
165
Číslo periodika v rámci svazku
10
Stát vydavatele periodika
AT - Rakouská republika
Počet stran výsledku
4
Strana od-do
2405-2408
Kód UT WoS článku
000556652100001
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85089082290