Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Natural Populations from the Phytophthora palustris Complex Show a High Diversity and Abundance of ssRNA and dsRNA Viruses

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43410%2F22%3A43922471" target="_blank" >RIV/62156489:43410/22:43922471 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.3390/jof8111118" target="_blank" >https://doi.org/10.3390/jof8111118</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3390/jof8111118" target="_blank" >10.3390/jof8111118</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Natural Populations from the Phytophthora palustris Complex Show a High Diversity and Abundance of ssRNA and dsRNA Viruses

  • Popis výsledku v původním jazyce

    We explored the virome of the &quot;Phytophthora palustris complex&quot;, a group of aquatic specialists geographically limited to Southeast and East Asia, the native origin of many destructive invasive forest Phytophthora spp. Based on high-throughput sequencing (RNAseq) of 112 isolates of &quot;P. palustris&quot; collected from rivers, mangroves, and ponds, and natural forests in subtropical and tropical areas in Indonesia, Taiwan, and Japan, 52 putative viruses were identified, which, to varying degrees, were phylogenetically related to the families Botybirnaviridae, Narnaviridae, Tombusviridae, and Totiviridae, and the order Bunyavirales. The prevalence of all viruses in their hosts was investigated and confirmed by RT-PCR. The rich virus composition, high abundance, and distribution discovered in our study indicate that viruses are naturally infecting taxa from the &quot;P. palustris complex&quot; in their natural niche, and that they are predominant members of the host cellular environment. Certain Indonesian localities are the viruses&apos; hotspots and particular &quot;P. palustris&quot; isolates show complex multiviral infections. This study defines the first bi-segmented bunya-like virus together with the first tombus-like and botybirna-like viruses in the genus Phytophthora and provides insights into the spread and evolution of RNA viruses in the natural populations of an oomycete species.

  • Název v anglickém jazyce

    Natural Populations from the Phytophthora palustris Complex Show a High Diversity and Abundance of ssRNA and dsRNA Viruses

  • Popis výsledku anglicky

    We explored the virome of the &quot;Phytophthora palustris complex&quot;, a group of aquatic specialists geographically limited to Southeast and East Asia, the native origin of many destructive invasive forest Phytophthora spp. Based on high-throughput sequencing (RNAseq) of 112 isolates of &quot;P. palustris&quot; collected from rivers, mangroves, and ponds, and natural forests in subtropical and tropical areas in Indonesia, Taiwan, and Japan, 52 putative viruses were identified, which, to varying degrees, were phylogenetically related to the families Botybirnaviridae, Narnaviridae, Tombusviridae, and Totiviridae, and the order Bunyavirales. The prevalence of all viruses in their hosts was investigated and confirmed by RT-PCR. The rich virus composition, high abundance, and distribution discovered in our study indicate that viruses are naturally infecting taxa from the &quot;P. palustris complex&quot; in their natural niche, and that they are predominant members of the host cellular environment. Certain Indonesian localities are the viruses&apos; hotspots and particular &quot;P. palustris&quot; isolates show complex multiviral infections. This study defines the first bi-segmented bunya-like virus together with the first tombus-like and botybirna-like viruses in the genus Phytophthora and provides insights into the spread and evolution of RNA viruses in the natural populations of an oomycete species.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    40102 - Forestry

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/EF15_003%2F0000453" target="_blank" >EF15_003/0000453: Výzkumné centrum pro studium patogenů z rodu Phytophthora</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2022

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Journal of Fungi

  • ISSN

    2309-608X

  • e-ISSN

    2309-608X

  • Svazek periodika

    8

  • Číslo periodika v rámci svazku

    11

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    28

  • Strana od-do

    1118

  • Kód UT WoS článku

    000882185100001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85141752701