Evaluation of the AFLP and MSAP methods as tools for studying of DNA changes in grapevine plants long period after their in vitro thermotherapy
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43510%2F12%3A00198664" target="_blank" >RIV/62156489:43510/12:00198664 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Evaluation of the AFLP and MSAP methods as tools for studying of DNA changes in grapevine plants long period after their in vitro thermotherapy
Popis výsledku v původním jazyce
To evaluate the impact of the stress induced by thermotherapy on the primary structure of DNA, AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) was applied in this study. Epigenetic changes were determined by means of MSAP (Methylation Sensitive Amplified Polymorphism). Studies were carried out on plants at different times after thermotherapy treatments (6 weeks to 5 years after it). The results show nearly identical AFLP-derived fingerprints in all analysed samples from plants treated by in vitro thermotherapy, suggesting that the stress condition did not provoke changes at the sequence level or the method is not suitable to detect possible changes. In contrast, MSAP allowed the observation of differences in epigenetic fingerprints in thermotherapy treated plants. Furthermore, the method allowed to determine the impact in a time dependent and quantifiable fashion. Plants sampled 6 weeks after thermotherapy showed most different epigenetic profiles, whereas plants with longer period after
Název v anglickém jazyce
Evaluation of the AFLP and MSAP methods as tools for studying of DNA changes in grapevine plants long period after their in vitro thermotherapy
Popis výsledku anglicky
To evaluate the impact of the stress induced by thermotherapy on the primary structure of DNA, AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) was applied in this study. Epigenetic changes were determined by means of MSAP (Methylation Sensitive Amplified Polymorphism). Studies were carried out on plants at different times after thermotherapy treatments (6 weeks to 5 years after it). The results show nearly identical AFLP-derived fingerprints in all analysed samples from plants treated by in vitro thermotherapy, suggesting that the stress condition did not provoke changes at the sequence level or the method is not suitable to detect possible changes. In contrast, MSAP allowed the observation of differences in epigenetic fingerprints in thermotherapy treated plants. Furthermore, the method allowed to determine the impact in a time dependent and quantifiable fashion. Plants sampled 6 weeks after thermotherapy showed most different epigenetic profiles, whereas plants with longer period after
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
GE - Šlechtění rostlin
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/QH91153" target="_blank" >QH91153: Využití in vitro kultur k ozdravení odrůd ovocných dřevin a révy vinné od virů, fytoplazem a karanténních patogenů pro systém certifikace výsadbového materiálu včetně ověřování kvality.</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2012
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Acta Horticulturae
ISSN
0567-7572
e-ISSN
—
Svazek periodika
961
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
BE - Belgické království
Počet stran výsledku
8
Strana od-do
73-80
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—