Rodová identifikace enterokoků detekcí tuf-genu metodou PCR

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16270%2F04%3A00000167" target="_blank" >RIV/62157124:16270/04:00000167 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Rodová identifikace enterokoků detekcí tuf-genu metodou PCR

Popis výsledku v původním jazyce

Cílem práce bylo zavést a optimalizovat metodu PCR založenou na detekci druhově specifického tuf genu umožňující rychlou rodovou konfirmaci enterokoků izolovaných z potravin, klinických či environmentálních vzorků. Reakce byla koncipována jako duplex-PCR, kdy mimo detekce rodově specifického tuf genu byla zařazena i interní kontrola (16S rRNA). Izolace DNA byla provedena lýzou suspenze bakteriálních buněk varem. Specifita PCR byla ověřena pomocí 16 sbírkových kmenů Gram-pozitivních a 2 kmenů Gram-negativních mikroorganismů, dále bylo metodou PCR vyšetřeno 169 kmenů enterokoků. Souhrnně lze konstatovat, že jednoduché, rychlé a finančně poměrně málo nákladné provedení PCR umožňuje její rutinní aplikaci při konfirmaci enterokoků izolovaných z různých zdrojů.

Název v anglickém jazyce

Genus-specific identification of enterococci detecting tuf-gene by PCR method

Popis výsledku anglicky

The aim of this study was to introduce and optimalise PCR method of tuf-gene detection enabling rapid genus-specific confirmation of enterococci isolated from food, clinical and environmental samples. The reaction was designed as duplex-PCR for the detection of genus-specific tuf gene and internal control (16S rRNA). DNA isolation was performed by lysis of bacterial cell suspension by boiling. PCR-specifity was verified by 16 collection strains of gram-positive and 2 strains of gram-negative microorganisms. By PCR method 169 strains of enterococci were investigated. Finally, we can postulate that PCR is simple, rapid and cost-effective method, enabling routine confirmation of enterococci isolated from different sources.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

GM - Potravinářství

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2004

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

XIII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2004, sborník abstraktů

ISBN

—

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

44

Strana od-do

3-4

Název nakladatele

Mikrobiologický ústav LF MU Brno a FN u svaté Anny v Brně

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

2. 6. 2004

Typ akce podle státní příslušnosti

CST - Celostátní akce

Kód UT WoS článku

—