Druhová identifikace bakterií rodu Enterococcus metodou PCR

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16270%2F04%3A00000166" target="_blank" >RIV/62157124:16270/04:00000166 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Druhová identifikace bakterií rodu Enterococcus metodou PCR

Popis výsledku v původním jazyce

Cílem práce bylo zavést a optimalizovat druhově specifickou metodu PCR založenou na použití primerů detekujících přítomnost genů kódujících D-alanin:D-alanin ligázu druhů Enterococcus faecalis (ddlE. faecalis) a Enterococcus faecium (ddlE. faecium). Reakce byla koncipována jako multiplex-PCR, kdy mimo detekce druhově specifických genů ddl byla zařazena i interní kontrola (úsek 16S rRNA genu). Izolace DNA byla provedena lýzou suspenze bakteriálních buněk varem. Specifita PCR byla ověřena pomocí 16 sbírkových kmenů Gram-pozitivních, včetně 8 druhů enterokoků, a 3 kmenů Gram-negativních mikroorganismů. Celkem bylo vyšetřeno 69 kmenů Enterococcus faecalis, 30 kmenů Enterococcus faecium a 21 kmenů dalších druhů enterokoků (E. durans, E. hirae, E. mundtii, E. casseliflavus, E. malodoratus). Přítomnost druhově specifického ddl-genu byla prokázána u všech E. faecalis a E. faecium. Metoda PCR se osvědčila jako vhodná pro druhovou identifikaci bakterií Enterococcus faecalis a Enterococcus faeciu

Název v anglickém jazyce

Species-specific identification of bacteria genus Enterococcus spp. by PCR method

Popis výsledku anglicky

The aim of this study was to introduce and optimalise Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium species-specific PCR method of ddl-gene detection. The reaction was designed as multiplex-PCR for the detection of species-specific ddl-genes and internal control (16S rRNA). DNA isolation was performed by lysis of bacterial cell suspension by boiling. PCR-specifity was verified by 16 collection strains of gram-positive microorganisms including 8 species of enterococci, and 3 strains of gram-negative microorganisms. In total there was investigated 69 strains of Enterococcus faecalis, 30 strains of Enterococcus faecium and 21 strains of other species of enterococci (Ent. durans, Ent. hirae, Ent. mundtii, Ent. casseliflavus, Ent. malodoratus). The presence of species-specific ddl-gene was demonstrated in all Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium strains. The PCR method is convenient for species-identification of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium bacteria.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

GM - Potravinářství

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2004

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

23. kongres Československé společnosti mikrobiologické - Abstrakty. Příloha Bulletinu Československé společnosti mikrobiologické

ISBN

0009-0646

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

1

Strana od-do

141

Název nakladatele

Československá společnost mikrobiologická

Místo vydání

Praha

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

6. 9. 2004

Typ akce podle státní příslušnosti

CST - Celostátní akce

Kód UT WoS článku

—