Detekce a identifikace původců mykotických infekcí způsobených vláknitými houbami pomocí metod molekulární genetiky

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F65269705%3A_____%2F12%3A%230001652" target="_blank" >RIV/65269705:_____/12:#0001652 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216224:14740/12:00058700

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Detekce a identifikace původců mykotických infekcí způsobených vláknitými houbami pomocí metod molekulární genetiky

Popis výsledku v původním jazyce

Metody molekulární genetiky nabízejí možnost rychlé a citlivé detekce a identifikace houbových patogenů. Používané diagnostické metody jsou založeny převážně na PCR. Vzhledem k tomu, že houby jsou takřka všudy přítomné, je třeba zabránit kontaminaci v průběhu celého procesu od odběru vzorku až po laboratorní analýzy. Molekulárně genetické metody diagnostiky nepatří mezi kritéria EORTC/MSG pro stanovení mykotických onemocnění, protože stále chybí mezilaboratorní standardizace těchto metod. dalším důvodemje používání různých cílových genů pro PCR. Pro druhovou identifikaci se doporučuje používat variabilní sekvence mezerníků (ITS) v genech pro rRNA. Určování hub pomocí sekventování DNA s sebou nese jistá úskalí a interpretace výsledků může být v některých případech problematická. Sekvence DNA se vyhledávají v internetových databázích, z níchž nejznámější je GenBank. Spolehlivější data pro identifikaci hub však poskytují specializované mykologické databáze.

Název v anglickém jazyce

Detection and identification of filamentous fungi causing mycoses using molecular genetic methods

Popis výsledku anglicky

Methods of molecular genetics offer rapid and sensitive detection and identification of fungal pathogens. The currently used methods are based mainly on PCR. With regard to the ubiquitous presence of fungi, it is important to prevent contamination duringthe whole process, from sampling to laboratory analyses. Molecular genetics methods are not included among the EORTC/MSG criteria used for the diagnosis of invasive fungal diseases since interlaboratory standardization is stil missing. Another reason isthe use of different target genes for PCR. ITS sequences from rDNA clusters are recommended for DNA barcoding of fungi. The use of DNA sequencing for identification of fungi in clinical samples has certain limitations and interpretation of results couldbe problematic in some cases. DNA sequences are searched and compared in public databases on the Internet, the best known of them being the GenBank. However, more reliable data for identification of fungi are offerd by specialized mycolo

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

FD - Onkologie a hematologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2012

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Klinická mikrobiologie a infekční lékařství

ISSN

1211-264X

e-ISSN

—

Svazek periodika

18

Číslo periodika v rámci svazku

4

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

109-114

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—