Kompenzace jasového útlumu s hloubkou obrazů získaných konfokálním mikroskopem použitím deformačního modelu markovských náhodných polí a řezů grafem

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985823%3A_____%2F08%3A00313677" target="_blank" >RIV/67985823:_____/08:00313677 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/68407700:21460/08:12142218

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Compensation of the Light Attenuation with Depth of Images Captured by a Confocal Microscope Using a MRF Deformation Model and Graph Cuts

Popis výsledku v původním jazyce

We study series of fluorescent optical sections, i.e. three-dimensional (3D) biomedical images, captured by a confocal laser scanning microscope (CLSM). Fluorescent image intensities of optical sections from deep layers of the specimen are often darker than intensities of sections from the top layers due to absorption and scattering of both excitation and fluorescent light. To solve this problem we apply a Markov Random Field (MRF) model - including an efficient deformation model for tracking structureswithin the 3D images - for computation of optical flow. We approach the corresponding optimization problem by the graph cuts. Image intensities of optical sections are recomputed according to the found optical flow, since the flow gives us evaluation oftheir proper brightness. Finally, the light attenuation with depth is compensated by matching accumulative histograms of optical sections of the original series with respect to optical sections improved by the optical flow

Název v anglickém jazyce

Compensation of the Light Attenuation with Depth of Images Captured by a Confocal Microscope Using a MRF Deformation Model and Graph Cuts

Popis výsledku anglicky

We study series of fluorescent optical sections, i.e. three-dimensional (3D) biomedical images, captured by a confocal laser scanning microscope (CLSM). Fluorescent image intensities of optical sections from deep layers of the specimen are often darker than intensities of sections from the top layers due to absorption and scattering of both excitation and fluorescent light. To solve this problem we apply a Markov Random Field (MRF) model - including an efficient deformation model for tracking structureswithin the 3D images - for computation of optical flow. We approach the corresponding optimization problem by the graph cuts. Image intensities of optical sections are recomputed according to the found optical flow, since the flow gives us evaluation oftheir proper brightness. Finally, the light attenuation with depth is compensated by matching accumulative histograms of optical sections of the original series with respect to optical sections improved by the optical flow

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

JD - Využití počítačů, robotika a její aplikace

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2008

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Eurographics´08

ISBN

—

ISSN

1017-4656

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

—

Název nakladatele

The Eurographics Association

Místo vydání

Heraklion

Místo konání akce

Heraklion

Datum konání akce

14. 4. 2008

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—