Evoluce plastidového pseudogenu trnF(GAA) v čeledi Brassicaceae

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985939%3A_____%2F07%3A00082961" target="_blank" >RIV/67985939:_____/07:00082961 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216224:14310/07:00019410

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Supernetwork identifies multiple events of plastid trnF(GAA) pseudogene evolution in the Brassicaceae

Popis výsledku v původním jazyce

We describe the first large-scale supernetwork for the Brassiccaeae built from gene trees for 5 loci (adh, chs, matK, trnL-F, and ITS) and report multiple independent origins for trnF pseudogenes in crucifers. Length variation of the trnL-F intergenic spacer region in different taxa ranges from 219 to 900 bp as a result of differences in pseudocopy number (1?14). It is speculated that functional constraints favor 2?3 or 5?6 copies, as found in Arabidopsis and Boechera. The phylogenetic distribution of microstructural changes for the trnL-F region supports ancient patterns of divergence in crucifer evolution for some but not all gene loci.

Název v anglickém jazyce

Supernetwork identifies multiple events of plastid trnF(GAA) pseudogene evolution in the Brassicaceae

Popis výsledku anglicky

We describe the first large-scale supernetwork for the Brassiccaeae built from gene trees for 5 loci (adh, chs, matK, trnL-F, and ITS) and report multiple independent origins for trnF pseudogenes in crucifers. Length variation of the trnL-F intergenic spacer region in different taxa ranges from 219 to 900 bp as a result of differences in pseudocopy number (1?14). It is speculated that functional constraints favor 2?3 or 5?6 copies, as found in Arabidopsis and Boechera. The phylogenetic distribution of microstructural changes for the trnL-F region supports ancient patterns of divergence in crucifer evolution for some but not all gene loci.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EF - Botanika

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2007

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Molecular Biology and Evolution

ISSN

0737-4038

e-ISSN

—

Svazek periodika

24

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

11

Strana od-do

63-73

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—