Letter to the Editor: Significant mutation enrichment in inverted repeat sites of new SARS-CoV-2 strains

Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F21%3A00555649" target="_blank" >RIV/68081707:_____/21:00555649 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61988987:17310/21:A2202CPW RIV/00216224:14310/21:00121296
Výsledek na webu
<a href="https://academic.oup.com/bib/article/22/5/bbab129/6219140" target="_blank" >https://academic.oup.com/bib/article/22/5/bbab129/6219140</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/bib/bbab129" target="_blank" >10.1093/bib/bbab129</a>

Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Letter to the Editor: Significant mutation enrichment in inverted repeat sites of new SARS-CoV-2 strains
Popis výsledku v původním jazyce
In a recently published paper, we have found that SARS-CoV-2 hot-spot mutations are significantly associated with inverted repeat loci and CG dinucleotides. However, fast-spreading strains with new mutations (so-called mink farm mutations, England mutations and Japan mutations) have been recently described. We used the new datasets to check the positioning of mutation sites in genomes of the new SARS-CoV-2 strains. Using an open-access Palindrome analyzer tool, we found mutations in these new strains to be significantly enriched in inverted repeat loci.
Název v anglickém jazyce
Letter to the Editor: Significant mutation enrichment in inverted repeat sites of new SARS-CoV-2 strains
Popis výsledku anglicky
In a recently published paper, we have found that SARS-CoV-2 hot-spot mutations are significantly associated with inverted repeat loci and CG dinucleotides. However, fast-spreading strains with new mutations (so-called mink farm mutations, England mutations and Japan mutations) have been recently described. We used the new datasets to check the positioning of mutation sites in genomes of the new SARS-CoV-2 strains. Using an open-access Palindrome analyzer tool, we found mutations in these new strains to be significantly enriched in inverted repeat loci.

Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění
2021
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika
Briefings in Bioinformatics
ISSN
1467-5463
e-ISSN
1477-4054
Svazek periodika
22
Číslo periodika v rámci svazku
5
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
2
Strana od-do
bbab129
Kód UT WoS článku
000709461800149
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85116173294

Podobné výsledky(10)