Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Interaction of C-terminal p53 isoforms depends strongly upon DNA sequence and topology

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F23%3A00574514" target="_blank" >RIV/68081707:_____/23:00574514 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/62156489:43110/23:43922658 RIV/00216305:26210/22:PU146617

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0300908422003352?via%3Dihub" target="_blank" >https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0300908422003352?via%3Dihub</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.biochi.2022.12.011" target="_blank" >10.1016/j.biochi.2022.12.011</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Interaction of C-terminal p53 isoforms depends strongly upon DNA sequence and topology

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The p53 protein is a key tumor suppressor and the most commonly mutated and down-regulated protein in human tumors. It functions mainly through interaction with DNA, and p53 acts as a transcription factor that recognizes the so-called p53 target sites on the promoters of various genes. P53 has been shown to exist as many isoforms, including three C-terminal isoforms that are produced by alternative splicing. Because the C-terminal domain is responsible for sequence-nonspecific binding and regulation of p53 binding, we have analyzed DNA recognition by these C-terminal isoforms. Using atomic force microscopy, we show for the first time that all C-terminal isoforms recognize superhelical DNA. It is particularly noteworthy that a sequence-specific p53 consensus binding site is bound by p53a and b isoforms with similar affinities, whilst p53a shows higher binding to a quadruplex sequence than both p53b and p53g, and p53g loses preferential binding to both the consensus binding sequence and the quadruplex-forming sequence. These results show the important role of the variable p53 C-terminal amino acid sequences for DNA recognition. (c) 2022 Elsevier B.V. and Societe Francaise de Biochimie et Biologie Moleculaire (SFBBM). All rights reserved.

  • Název v anglickém jazyce

    Interaction of C-terminal p53 isoforms depends strongly upon DNA sequence and topology

  • Popis výsledku anglicky

    The p53 protein is a key tumor suppressor and the most commonly mutated and down-regulated protein in human tumors. It functions mainly through interaction with DNA, and p53 acts as a transcription factor that recognizes the so-called p53 target sites on the promoters of various genes. P53 has been shown to exist as many isoforms, including three C-terminal isoforms that are produced by alternative splicing. Because the C-terminal domain is responsible for sequence-nonspecific binding and regulation of p53 binding, we have analyzed DNA recognition by these C-terminal isoforms. Using atomic force microscopy, we show for the first time that all C-terminal isoforms recognize superhelical DNA. It is particularly noteworthy that a sequence-specific p53 consensus binding site is bound by p53a and b isoforms with similar affinities, whilst p53a shows higher binding to a quadruplex sequence than both p53b and p53g, and p53g loses preferential binding to both the consensus binding sequence and the quadruplex-forming sequence. These results show the important role of the variable p53 C-terminal amino acid sequences for DNA recognition. (c) 2022 Elsevier B.V. and Societe Francaise de Biochimie et Biologie Moleculaire (SFBBM). All rights reserved.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA22-21903S" target="_blank" >GA22-21903S: Lokální struktury DNA a jejich role ve funkci mutantního proteinu p53 z lidských nádorů</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2023

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Biochimie

  • ISSN

    0300-9084

  • e-ISSN

    1638-6183

  • Svazek periodika

    208

  • Číslo periodika v rámci svazku

    MAY 2023

  • Stát vydavatele periodika

    NL - Nizozemsko

  • Počet stran výsledku

    7

  • Strana od-do

    93-99

  • Kód UT WoS článku

    001009864200001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85144931283