Partial genetic characterization of Sedlec virus (Orthobunyavirus, Bunyaviridae)
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081766%3A_____%2F13%3A00395843" target="_blank" >RIV/68081766:_____/13:00395843 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2013.07.025" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2013.07.025</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2013.07.025" target="_blank" >10.1016/j.meegid.2013.07.025</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Partial genetic characterization of Sedlec virus (Orthobunyavirus, Bunyaviridae)
Popis výsledku v původním jazyce
Sedlec virus (SEDV) was isolated from the blood of a reed warbler (Acrocephalus scirpaceus) in July 1984 in South Moravia, Czech Republic. In this study first genetic data of SEDV are presented which allow an estimate on its phylogenetic and taxonomic positioning within the genus Orthobunyavirus. The phylogenetic analysis of a 369 nt long stretch within the S segment (nucleocapsid protein gene and non-structural S protein gene) indicates genetic relatedness of SEDV to Leanyer virus and Simbu group viruses, while the phylogenetic tree based on 1796 nt long sequences of the L segment (RNA-dependent RNA polymerase gene) demonstrates genetic relationship of SEDV to two yet unclassified orthobunyaviruses: I612045 virus (isolated in India in 1961) and Oyo virus (isolated in Nigeria in 1964). Considering the genetic distances and the phylogenetic analyses, SEDV might represent a novel serogroup of the Orthobunyavirus genus.
Název v anglickém jazyce
Partial genetic characterization of Sedlec virus (Orthobunyavirus, Bunyaviridae)
Popis výsledku anglicky
Sedlec virus (SEDV) was isolated from the blood of a reed warbler (Acrocephalus scirpaceus) in July 1984 in South Moravia, Czech Republic. In this study first genetic data of SEDV are presented which allow an estimate on its phylogenetic and taxonomic positioning within the genus Orthobunyavirus. The phylogenetic analysis of a 369 nt long stretch within the S segment (nucleocapsid protein gene and non-structural S protein gene) indicates genetic relatedness of SEDV to Leanyer virus and Simbu group viruses, while the phylogenetic tree based on 1796 nt long sequences of the L segment (RNA-dependent RNA polymerase gene) demonstrates genetic relationship of SEDV to two yet unclassified orthobunyaviruses: I612045 virus (isolated in India in 1961) and Oyo virus (isolated in Nigeria in 1964). Considering the genetic distances and the phylogenetic analyses, SEDV might represent a novel serogroup of the Orthobunyavirus genus.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2013
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Infection, Genetics and Evolution
ISSN
1567-1348
e-ISSN
—
Svazek periodika
19
Číslo periodika v rámci svazku
October
Stát vydavatele periodika
NL - Nizozemsko
Počet stran výsledku
6
Strana od-do
244-249
Kód UT WoS článku
000327698700034
EID výsledku v databázi Scopus
—