Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Discovery of common and rare genetic risk variants for colorectal cancer

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378041%3A_____%2F19%3A00518235" target="_blank" >RIV/68378041:_____/19:00518235 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216208:11110/19:10392338 RIV/00216208:11140/19:10392338

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.nature.com/articles/s41588-018-0286-6" target="_blank" >https://www.nature.com/articles/s41588-018-0286-6</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41588-018-0286-6" target="_blank" >10.1038/s41588-018-0286-6</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Discovery of common and rare genetic risk variants for colorectal cancer

  • Popis výsledku v původním jazyce

    To further dissect the genetic architecture of colorectal cancer (CRC), we performed whole-genome sequencing of 1,439 cases and 720 controls, imputed discovered sequence variants and Haplotype Reference Consortium panel variants into genome-wide association study data, and tested for association in 34,869 cases and 29,051 controls. Findings were followed up in an additional 23,262 cases and 38,296 controls. We discovered a strongly protective 0.3% frequency variant signal at CHD1. In a combined meta-analysis of 125,478 individuals, we identified 40 new independent signals at P < 5 x 10(-8), bringing the number of known independent signals for CRC to similar to 100. New signals implicate lower-frequency variants, Kruppel-like factors, Hedgehog signaling, Hippo-YAP signaling, long noncoding RNAs and somatic drivers, and support a role for immune function. Heritability analyses suggest that CRC risk is highly polygenic, and larger, more comprehensive studies enabling rare variant analysis will improve understanding of biology underlying this risk and influence personalized screening strategies and drug development.

  • Název v anglickém jazyce

    Discovery of common and rare genetic risk variants for colorectal cancer

  • Popis výsledku anglicky

    To further dissect the genetic architecture of colorectal cancer (CRC), we performed whole-genome sequencing of 1,439 cases and 720 controls, imputed discovered sequence variants and Haplotype Reference Consortium panel variants into genome-wide association study data, and tested for association in 34,869 cases and 29,051 controls. Findings were followed up in an additional 23,262 cases and 38,296 controls. We discovered a strongly protective 0.3% frequency variant signal at CHD1. In a combined meta-analysis of 125,478 individuals, we identified 40 new independent signals at P < 5 x 10(-8), bringing the number of known independent signals for CRC to similar to 100. New signals implicate lower-frequency variants, Kruppel-like factors, Hedgehog signaling, Hippo-YAP signaling, long noncoding RNAs and somatic drivers, and support a role for immune function. Heritability analyses suggest that CRC risk is highly polygenic, and larger, more comprehensive studies enabling rare variant analysis will improve understanding of biology underlying this risk and influence personalized screening strategies and drug development.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    30101 - Human genetics

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/LO1503" target="_blank" >LO1503: BIOMEDIC</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2019

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Nature Genetics

  • ISSN

    1061-4036

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    51

  • Číslo periodika v rámci svazku

    1

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    24

  • Strana od-do

    76-99

  • Kód UT WoS článku

    000454108800015

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85058017067