Vazba fenylnorstatinového inhibitoru na proteázu HIV-1: geometrie, protonace a interakce kapes podřadných míst analyzované při atomovém rozlišení

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F04%3A00105275" target="_blank" >RIV/68378050:_____/04:00105275 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

A Phenylnorstatine Inhibitor Binding to HIV-1 Protease: Geometry, Protonation, and Subsite-Pocket Interactions Analyzed at Atomic Resolution

Popis výsledku v původním jazyce

The X-ray structure of a complex of HIV-1 protease (PR) with a phenylnorstatine inhibitor Z-Pns-Phe-Glu-Glu-NH(2) has been determined at 1.03 A, the highest resolution so far reported for any HIV PR complex. The inhibitor shows subnanomolar K(i) values for both the wild-type PR and the variant representing one of the most common mutations linked to resistance development. The structure comprising the phenylnorstatine moiety of (2R,3S)-chirality displays a unique pattern of hydrogen bonding to the two catalytic aspartate residues. This high resolution makes it possible to assess the donor and acceptor relations of this hydrogen bonding and to indicate a proton shared by the two catalytic residues. A structural mechanism for the unimpaired inhibition ofthe protease Val82Ala mutant is also suggested, based on energy calculations and analyses

Název v anglickém jazyce

A Phenylnorstatine Inhibitor Binding to HIV-1 Protease: Geometry, Protonation, and Subsite-Pocket Interactions Analyzed at Atomic Resolution

Popis výsledku anglicky

The X-ray structure of a complex of HIV-1 protease (PR) with a phenylnorstatine inhibitor Z-Pns-Phe-Glu-Glu-NH(2) has been determined at 1.03 A, the highest resolution so far reported for any HIV PR complex. The inhibitor shows subnanomolar K(i) values for both the wild-type PR and the variant representing one of the most common mutations linked to resistance development. The structure comprising the phenylnorstatine moiety of (2R,3S)-chirality displays a unique pattern of hydrogen bonding to the two catalytic aspartate residues. This high resolution makes it possible to assess the donor and acceptor relations of this hydrogen bonding and to indicate a proton shared by the two catalytic residues. A structural mechanism for the unimpaired inhibition ofthe protease Val82Ala mutant is also suggested, based on energy calculations and analyses

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CE - Biochemie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2004

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal of Medicinal Chemistry

ISSN

0022-2623

e-ISSN

—

Svazek periodika

47

Číslo periodika v rámci svazku

8

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

7

Strana od-do

2030-2036

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—