Metody molekulární genetiky ve výzkumu výskytu a aktivity chitinolytických bakterií v trávicím traktu býložravců a člověka
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21460%2F13%3A00213956" target="_blank" >RIV/68407700:21460/13:00213956 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Metody molekulární genetiky ve výzkumu výskytu a aktivity chitinolytických bakterií v trávicím traktu býložravců a člověka
Popis výsledku v původním jazyce
V této práci jsme se zaměřili na aplikaci metod molekulární biologie při studiu chitinolytických bakterií obývajících trávicí trakt různých druhů přežvýkavců a člověka. Jako kultivační médium bylo použito médium M-10 s koloidním chitinem jako zdrojem energie. Kultivace byla provedena za anaerobních podmínek. Chitinolytické bakterie byly izolovány z kultur obohacených fekáliemi různých druhů přežvýkavců (daněk evropský, jelen milu, žirafa Rothschildova) a prebioticky ovlivněných osob. Izoláty byly vybrány na základě enzymatické aktivity změřené na CM chitinu a izoláty s vysokou aktivitou byly charakterizovány. Identifikace kmenů s chitinolytickými aktivitami byla realizována pomocí sekvenování genu 16S rRNA. Charakterizace schopnosti rozkládat chitinovýsubstrát byla provedena metodou zymografie. Ze všech izolátů byl osekvenován gen kódující chitinázu B a fylogeneticky porovnán. Tato práce je podporována GAČR (Project No. 310/09/1407
Název v anglickém jazyce
Methods of molecular genetics in the research of occurence and activity of chitinolytic bacteria in the gastrointestinal tract of herbivores and human
Popis výsledku anglicky
In this study we focused on the application of molecular biology methods for characterization chitinolytic bacteria from the herbivoral and human digestive tract. As cultivation media were used M-10 medium with colloid chitin as source of energy. Cultivation was carried out under anaerobic conditions. Chitinolytic bacteria were isolated from enrichment culture with faeces of different wild ruminants (fallow dear, Pere David's deer, Rothschild's giraffe) and faeces of prebiotic affected persons. Isolateswere selected according to their activity towards CM chitin and then characterized. The identification of strains with chitinolytic activities was made by 16S rRNA sequencing method. Characterization of biochemical ability to degrade chitin substrate was performed by zymography technique. Gene coding chitinase B enzyme from all isolates was sequenced and phylogenetically analyzed. This work was supported by The Grant Agency of the Czech Republic (Project No. 310/09/1407).
Klasifikace
Druh
O - Ostatní výsledky
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/EE.2.3.20.0092" target="_blank" >EE.2.3.20.0092: Rozvoj výzkumného týmu BIO-OPT-XUV na FBMI ČVUT</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2013
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů